RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W GEP3Q08622 556 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W APA1P16550 321 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YSR3P23501 404 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W MSH1P25846 959 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W PRX1P34227 261 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SER3P40054 469 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W VFA1P40080 203 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W MNT3P40549 630 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W MKT1P40850 830 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W ELP2P42935 788 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YFR020WP43600 232 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W IDS2P46958 469 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YGL108CP53139 140 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W ARE2P53629 642 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W BET4Q00618 327 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W REG1Q00816 1014 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W EMI1Q04406 187 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RSF1Q05043 376 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SWC7Q06707 132 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RAX1Q08760 435 aa2.12□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W COX5AP00424 153 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CDC33P07260 213 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W KAR3P17119 729 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CLC1P17891 233 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W EPT1P22140 391 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RBK1P25332 333 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W MSP1P28737 362 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W MKK1P32490 508 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W ASK1P35734 292 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RPH1P39956 796 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YEL028WP39989 153 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SEC24P40482 926 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YIL086CP40503 102 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SAP185P40856 1058 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W AIP1P46680 615 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SIP4P46954 829 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W FRE4P53746 719 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YNL058CP53947 316 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W MDM30Q05930 598 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CYK3Q07533 885 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W GPM3Q12326 303 aa2.11□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YPK1P12688 680 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W URE2P23202 354 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W NAM9P27929 486 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W MSR1P38714 643 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CYC2P38909 366 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SPC72P39723 622 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W LAS21P40367 830 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YIL054WP40524 105 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CIR1P42940 261 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RRT5P43607 289 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W COG1P53079 417 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W NUP116Q02630 1113 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W ATG16Q03818 150 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W VPS20Q04272 221 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YLR049CQ12110 428 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CRC1Q12289 327 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W GRR1P24814 1151 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SPS19P32573 292 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W GDA1P32621 518 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W PTH2P34222 208 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W MRPL15P36523 253 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W EFM2P38347 419 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W LNP1P38878 278 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YEL073CP39974 107 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CAB2P40506 365 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W TES1P41903 349 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YFR018CP43599 363 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RPC17P47076 161 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W TRM9P49957 279 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W COS12P53053 380 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W STR3P53101 465 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W TIM13P53299 105 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W ESBP6P53918 673 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YET2Q04210 160 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RAD33Q04231 177 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W HER1Q12276 1246 aa2.1□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W COX1P00401 534 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W HOM3P10869 527 aa2.09□□□□□ -2.07
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