RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A HXT3P32466 567 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RPN12P32496 274 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PRP21P32524 280 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YEL045CP32616 141 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A STB6P36085 766 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A MRPL4P36517 319 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A MST28P39552 234 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A NDE1P40215 560 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A OST1P41543 476 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A DLD2P46681 530 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A FMS1P50264 508 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PCP1P53259 346 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A HSP31Q04432 237 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SGT1Q08446 395 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RTN2Q12443 393 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RAD61Q99359 647 aa2.21□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RIP1P08067 215 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RPL3P14126 387 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RPI1P23250 407 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PPH22P23595 377 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A CLB3P24870 427 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A HCS1P34243 683 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RIB5P38145 238 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A VHC1P38329 1120 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YHR054CP38780 354 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PRE5P40302 234 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A LAM5P43560 674 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SDT1P53078 280 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A TOF1P53840 1238 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A KTR5P53966 522 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A HER2Q03557 464 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A TAF11Q04226 346 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A COG4Q06096 861 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A TIM18Q08749 192 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A TMS1Q12116 473 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SFI1Q12369 946 aa2.2□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A CDC31P06704 161 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A ERG3P32353 365 aa2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A ARA1P38115 344 aa2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PRM5P40476 318 aa2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YNR048WP53740 393 aa2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A GOR1P53839 350 aa2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A MDG1P53885 366 aa2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YMR181CQ03231 154 aa2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YDR387CQ04162 555 aa2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A HSP42Q12329 375 aa2.19□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A ARG4P04076 463 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PET123P17558 318 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A DAL2P25335 343 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A KRE2P27809 442 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SIN4P32259 974 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A NPL6P32832 435 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A NFU1P32860 256 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A MTC6P38849 526 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.18□□□□□ -2.06not detected
RPC10YHR143W-A FAA2P39518 744 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SAS2P40963 338 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A NCA3P46955 337 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SRB7P47822 140 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YGL039WP53183 348 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A ADD37Q03233 198 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A MRPL35Q06678 367 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SIL1Q08199 421 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YPR022CQ12139 1133 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SCM3Q12334 223 aa2.18□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A INH1P01097 85 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SEC63P14906 663 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SPR1P32603 445 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A RML2P32611 393 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A KKQ8P36004 724 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A JNM1P36224 373 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PIM1P36775 1133 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A NTC20P38302 140 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A FRE4P53746 719 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YIF1P53845 314 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A MDM1Q01846 1127 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PPM1Q04081 328 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YLR287CQ05881 355 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A HRI1Q05905 244 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A REX4Q08237 289 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A HRT3Q12347 344 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A PGA3Q12746 312 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A YOL159C-AQ3E769 90 aa2.17□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A CLN3P13365 580 aa2.16□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A REC107P21651 314 aa2.16□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A LSB5P25369 354 aa2.16□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A CDC60P26637 1090 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RPC10YHR143W-A SAS3P34218 831 aa2.16□□□□□ -2.06
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