RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C YMD8Q03697 442 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CSN9Q03981 162 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YLR224WQ05947 369 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ADY4Q05955 493 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GPN3Q06543 272 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C IRC3Q06683 689 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C INP54Q08227 384 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C FRE3Q08905 711 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C DIN7Q12086 430 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YPL066WQ12194 479 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YLL058WQ12198 575 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C KCS1Q12494 1050 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CMR1Q12510 522 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YPR015CQ12531 247 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YOL159C-AQ3E769 90 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MHF1Q3E835 90 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PMA1P05030 918 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ARG81P05085 880 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C KIN28P06242 306 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MATALPHA1P0CY06 175 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C HMLALPHA1P0CY07 175 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C FRS1P15624 595 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MET16P18408 261 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C TRX1P22217 103 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C HCM1P25364 564 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PHO91P27514 894 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YIM1P28625 365 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PGM1P33401 570 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SPO23P33757 523 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SHP1P34223 423 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PTC1P35182 281 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C OAR1P35731 278 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MAL32P38158 584 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MMS4P38257 691 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C EXO5P38289 585 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SPL2P38839 148 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C VPS45P38932 577 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YJL206CP39529 758 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MIT1P40002 666 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C UTP7P40055 554 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YMR144WP40214 342 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RFC2P40348 353 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ALG8P40351 577 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PGD1P40356 397 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ARG2P40360 574 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YIL054WP40524 105 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YGR201CP42936 225 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C IDS2P46958 469 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ASG7P46993 209 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YJL045WP47052 634 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MOG1P47123 218 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C AAD10P47182 288 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GTO1P48239 356 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C AZR1P50080 613 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C NBP35P52920 328 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SEH1P53011 349 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RTA1P53047 317 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YGR168CP53293 376 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MAL12P53341 584 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YNR065CP53751 1116 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PRM1P53835 661 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MRPL22P53881 309 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CBK1P53894 756 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C HDA1P53973 706 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YAT1P80235 687 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ARP4P80428 489 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PEX13P80667 386 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YPL113CQ02961 396 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C BOP2Q06150 570 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ENV7Q12003 364 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YLR108CQ12259 485 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RBD2Q12270 262 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GLO4Q12320 285 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C LPX1Q12405 387 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ISN1Q99312 450 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SAS5Q99314 248 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MPD2Q99316 277 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RIM15P43565 1770 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YMR084WA2P2R3 262 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CET1O13297 549 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CDC28P00546 298 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SCEIP03882 235 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MRP1P10662 321 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data3.38□□□□□ -1.87not detected
SPT4YGR063C DAL81P21657 970 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SEC62P21825 274 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PPH22P23595 377 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PPZ1P26570 692 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data3.38□□□□□ -1.87not detected
SPT4YGR063C ATP11P32453 318 aa3.38□□□□□ -1.87
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