RNA–Protein interactions for RNA: YFR057W

YFR057W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YFR057W, Length 456 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR057WYFR057W OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W NDE1P40215 560 aa3.42□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W SSN8P47821 323 aa3.42□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W HSP31Q04432 237 aa3.42□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W MUM3Q08750 479 aa3.42□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W RAD61Q99359 647 aa3.42□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W GPH1P06738 902 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W RIP1P08067 215 aa3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W PPH22P23595 377 aa3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W SPS22P25380 463 aa3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W STB6P36085 766 aa3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W SWD3P38123 315 aa3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W WWM1P43582 211 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W MRPL19P53875 158 aa3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W YDR387CQ04162 555 aa3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W HRT3Q12347 344 aa3.41□□□□□ -1.86
YFR057WYFR057W CLN3P13365 580 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RPL3P14126 387 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SEC63P14906 663 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W ITR1P30605 584 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W APE2P32454 952 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RIB5P38145 238 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W PTH1P38876 190 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W PRM5P40476 318 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W LAM5P43560 674 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W ECM27P47144 725 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SDT1P53078 280 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W TAF11Q04226 346 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W VTA1Q06263 330 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W YPR022CQ12139 1133 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RTN2Q12443 393 aa3.4□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SWE1P32944 819 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SAS2P40963 338 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W HXT11P54862 567 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W TIM18Q08749 192 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W YOL159C-AQ3E769 90 aa3.39□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W ADH2P00331 348 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RPI1P23250 407 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W PIM1P36775 1133 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W VHC1P38329 1120 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W NCA3P46955 337 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SUB1P54000 292 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W MHR1Q06630 226 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SIL1Q08199 421 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RTP1Q12751 981 aa3.38□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W ERG3P32353 365 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SPR1P32603 445 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W YBR137WP38276 179 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RFC3P38629 340 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W YHR054CP38780 354 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W DLD2P46681 530 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W YNR048WP53740 393 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W FRE4P53746 719 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W YIF1P53845 314 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W YMR181CQ03231 154 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RBD2Q12270 262 aa3.37□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RED1P14291 827 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W PET123P17558 318 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SIN4P32259 974 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SAS3P34218 831 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W MTC6P38849 526 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W HER2Q03557 464 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W PPM1Q04081 328 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SGT1Q08446 395 aa3.36□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RPN12P32496 274 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RML2P32611 393 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W HCS1P34243 683 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W MSG5P38590 489 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.35□□□□□ -1.87not detected
YFR057WYFR057W PAN6P40459 309 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W FMS1P50264 508 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W MDM30Q05930 598 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W COG4Q06096 861 aa3.35□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W TEF1P02994 458 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W CDC31P06704 161 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SLY1P22213 666 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W DAL2P25335 343 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W SNT1P25357 1226 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W HXT1P32465 570 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W ARA1P38115 344 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W RRT2P38332 387 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W TIS11P47977 285 aa3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YFR057WYFR057W MTM1P53320 366 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms