RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W HIP1P06775 603 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W PMR1P13586 950 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W APE2P32454 952 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W NAT2P37293 288 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W SSU1P41930 458 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W ECM27P47144 725 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W PCP1P53259 346 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W SIL1Q08199 421 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W RRD2Q12461 358 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YCL021W-AQ96VH3 125 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YRF1-4O13559 1382 aa3□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W HIS4P00815 799 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W RIP1P08067 215 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W RPI1P23250 407 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W ECM25P32525 599 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W RML2P32611 393 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YCR041WP37265 110 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YHR054CP38780 354 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W CCT2P39076 527 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W COS5P47187 383 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YIP1P53039 248 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YGL138CP53122 345 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YIF1P53845 314 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W IBD2P53892 351 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W ARK1P53974 638 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W MRP51Q02950 344 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W RRN11Q04712 507 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W COS7Q07788 383 aa2.99□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W SAM1P10659 382 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W HEM15P16622 393 aa2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W SAM2P19358 384 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W RNA14P25298 677 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W LSB5P25369 354 aa2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YME2P32843 850 aa2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W LSM5P40089 93 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W PRE5P40302 234 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W RRT5P43607 289 aa2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W TRS85P46944 698 aa2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W ART5P53244 586 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W REX4Q08237 289 aa2.98□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YCR051WP25631 222 aa2.97□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W GOR1P53839 350 aa2.97□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W KAP120Q02932 1032 aa2.97□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W DON1Q05610 365 aa2.97□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W THP3Q12049 470 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W VAM3Q12241 283 aa2.97□□□□□ -1.93
NSE4YDL105W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W SPS22P25380 463 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W KRE2P27809 442 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W SIN4P32259 974 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W YEL045CP32616 141 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.96□□□□□ -1.94not detected
NSE4YDL105W MST28P39552 234 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W SAS2P40963 338 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W LAM5P43560 674 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W SKO1Q02100 647 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W ROY1Q04847 553 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W ESA1Q08649 445 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W TIM18Q08749 192 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W YLR108CQ12259 485 aa2.96□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W HHF1P02309 103 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W CHS1P08004 1131 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W RHB1P25378 209 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W BEM1P29366 551 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W TFB1P32776 642 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W YBL059WP34224 193 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W PIM1P36775 1133 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W RIB5P38145 238 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W MIX23P38162 196 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W MMS4P38257 691 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W NDT80P38830 627 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.95□□□□□ -1.94not detected
NSE4YDL105W YIL067CP40514 678 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W FRE4P53746 719 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W SGT1Q08446 395 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W YPR022CQ12139 1133 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W YER078W-AQ3E7A2 54 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W AFI1Q99222 893 aa2.95□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W SEC63P14906 663 aa2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W PDX1P16451 410 aa2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W DBF4P32325 704 aa2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W HIR2P32480 875 aa2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W SDH3P33421 198 aa2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W STB6P36085 766 aa2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W RFC3P38629 340 aa2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W OST1P41543 476 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W HMS2P47175 358 aa2.94□□□□□ -1.94
NSE4YDL105W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
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