RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0143Q0143 ARE2P53629 642 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
Q0143Q0143 EFM6P53970 246 aa-0.64□□□□□ -2.51
Q0143Q0143 RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
Q0143Q0143 RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
Q0143Q0143 MRPL36P36531 177 aa-0.65□□□□□ -2.51
Q0143Q0143 YCR041WP37265 110 aa-0.65□□□□□ -2.51
Q0143Q0143 BRE1Q07457 700 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
Q0143Q0143 NUS1Q12063 375 aa-0.65□□□□□ -2.51
Q0143Q0143 YGR161W-CQ3E744 92 aa-0.65□□□□□ -2.51
Q0143Q0143 TOP1P04786 769 aa-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 MSI1P13712 422 aa-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 RPB5P20434 215 aa-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 ITR1P30605 584 aa-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 ALK2P32789 676 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 COS4P43542 379 aa-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 BNS1P50084 137 aa-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 VPS4P52917 437 aa-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 PEX14P53112 341 aa-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 CMS1Q07897 291 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 FRE8Q12209 686 aa-0.66□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 ZRC1P20107 442 aa-0.67□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 ATG18P43601 500 aa-0.67□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 APT1P49435 187 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 OCA1P50946 238 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 LCL3P53153 274 aa-0.67□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 SYG1P40528 902 aa-0.68□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 TRR2P38816 342 aa-0.69□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 AXL2P38928 823 aa-0.69□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 SLZ1P40167 298 aa-0.69□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 NUP116Q02630 1113 aa-0.69□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 TMA17Q12513 150 aa-0.69□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 ATP11P32453 318 aa-0.7□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 EGT2P42835 1041 aa-0.7□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 URB2P47108 1174 aa-0.7□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 PIL1P53252 339 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 HIM1Q06674 414 aa-0.7□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 YPR022CQ12139 1133 aa-0.7□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 SST2P11972 698 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 ZIP1P31111 875 aa-0.71□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 TKL2P33315 681 aa-0.71□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 YIP1P53039 248 aa-0.71□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 TGL2P54857 326 aa-0.71□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 RPT6Q01939 405 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 DPH1P40487 425 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 POP1P41812 875 aa-0.72□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 NUP57P48837 541 aa-0.72□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 TOF2Q02208 771 aa-0.72□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
Q0143Q0143 POL4P25615 582 aa-0.73□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 PSF2P40359 213 aa-0.73□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 LDS2Q08218 356 aa-0.73□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 TFS1P14306 219 aa-0.74□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YBR144CP34215 104 aa-0.74□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 RHO5P53879 331 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 INP2Q03824 705 aa-0.74□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 COQ9Q05779 260 aa-0.74□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 MIG1P27705 504 aa-0.75□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 ALY1P36117 915 aa-0.75□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 GRX7P38068 203 aa-0.75□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 JLP2P40206 208 aa-0.75□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YLR302CO13544 120 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 DEP1P31385 405 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 SKT5P34226 696 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 ASP1P38986 381 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 PTI1P39927 425 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YIL029CP40538 142 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 AIM22P47051 409 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YGL088WP53151 121 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 MST27P53176 234 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 RTN1Q04947 295 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 MRX8Q05473 314 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.76□□□□□ -2.53not detected
Q0143Q0143 NAG1Q8TGN9 163 aa-0.76□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 RPS23BP0CX30 145 aa-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 SSE2P32590 693 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YEF1P32622 495 aa-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 UBP11P36026 717 aa-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 FRM2P37261 193 aa-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 CBP4P37267 147 aa-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YNR048WP53740 393 aa-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 SOV1Q04748 898 aa-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 CEX1Q12453 761 aa-0.77□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 MF(ALPHA)1P01149 165 aa-0.78□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 ANR2P36090 516 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YKR032WP36127 104 aa-0.78□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 YNL208WP40159 199 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 VHT1P53241 593 aa-0.78□□□□□ -2.53
Q0143Q0143 FUS3P16892 353 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
Q0143Q0143 PAP1P29468 568 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
Q0143Q0143 TCD2P36101 447 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
Q0143Q0143 ECM34P38728 170 aa-0.79□□□□□ -2.54
Q0143Q0143 YFR054CP43622 192 aa-0.79□□□□□ -2.54
Q0143Q0143 BUD22Q04347 519 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
Q0143Q0143 CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
Q0143Q0143 HSC82P15108 705 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
Q0143Q0143 PEX22P39718 180 aa-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.3 ms