RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 CDC45O75419 566 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 CALM1P0DP23 149 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 CALM2P0DP24 149 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 CALM3P0DP25 149 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 MFSD10Q14728 455 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 RNF20Q5VTR2 975 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 RETREG2Q8NC44 543 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA33Q96N06 139 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 KAT6AQ92794 2004 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP4C-212ENST00000567828 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 F2P00734 622 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 PFKMP08237 780 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 IQCF3P0C7M6 154 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 BFSP2Q13515 415 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 MICU3Q86XE3 530 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 KATNAL1Q9BW62 490 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 MEIS2O14770 477 aa26.19■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 TGFB3P10600 412 aa26.19■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 C7orf31Q8N865 590 aa26.19■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 CUL5Q93034 780 aa26.19■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.19■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.19■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 MSRAQ9UJ68 235 aa26.19■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 TRANK1O15050 2925 aa26.19■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 HAS3O00219 553 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 RFC2P35250 354 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 RAB30Q15771 203 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 RASEFQ8IZ41 740 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC155Q8N6L0 562 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 NEK1Q96PY6 1258 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 RABGGTBP53611 331 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 SEMA3FQ13275 785 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 GNPTABQ3T906 1256 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 FANCBQ8NB91 859 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 CAGE1Q8TC20 777 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 PIK3CDO00329 1044 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 PPFIA4O75335 1185 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 STAM2O75886 525 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 APOA5Q6Q788 366 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.782e-10■■■□□ 16.7
PPP4C-212ENST00000567828 REV3LO60673 3130 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 DLL1O00548 723 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 ACTN1P12814 892 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 ICAM3P32942 547 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 AFAP1L1Q8TED9 768 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 MYOGP15173 224 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 UBE2SQ16763 222 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 CYFIP1Q7L576 1253 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 PRDM12Q9H4Q4 367 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP4C-212ENST00000567828 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.14■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 FIBPO43427 364 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 SELPP16109 830 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 HIC1Q14526 733 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 WNT8BQ93098 351 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 LGALS2P05162 132 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 CKBP12277 381 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 RBL2Q08999 1139 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 NEDD9Q14511 834 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 SLC28A3Q9HAS3 691 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 TELO2Q9Y4R8 837 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP4C-212ENST00000567828 VCANP13611 3396 aa26.12■■□□□ 1.77
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