RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542432.5

RECQL-208, Transcript of RecQ like helicase, human

TSL 3

Gene RECQL, Length 600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RECQL-208	ENST00000542432	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RECQL-208	ENST00000542432	C7orf31	Q8N865	590 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RECQL-208	ENST00000542432	RETREG2	Q8NC44	543 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RECQL-208	ENST00000542432	PPTC7	Q8NI37	304 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RECQL-208	ENST00000542432	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RECQL-208	ENST00000542432	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RECQL-208	ENST00000542432	CDC45	O75419	566 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	F2	P00734	622 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CPA1	P15085	419 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	LIFR	P42702	1097 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	TRAF1	Q13077	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SEMA3F	Q13275	785 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	FANCB	Q8NB91	859 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	WNT8B	Q93098	351 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	MAP3K14	Q99558	947 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CALM1	P0DP23	149 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CALM2	P0DP24	149 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CALM3	P0DP25	149 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	GNAQ	P50148	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	BFSP2	Q13515	415 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	GPNMB	Q14956	572 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SESTD1	Q86VW0	696 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	TRIM50	Q86XT4	487 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CUL5	Q93034	780 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SCN5A	Q14524	2016 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	HAS3	O00219	553 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	LGALS2	P05162	132 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CKB	P12277	381 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	RAB30	Q15771	203 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	APOA5	Q6Q788	366 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PGBD1	Q96JS3	809 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CERS4	Q9HA82	394 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	FIBP	O43427	364 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PPFIA4	O75335	1185 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PFKM	P08237	780 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	ACTN1	P12814	892 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SELP	P16109	830 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	ADGRE1	Q14246	886 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	RTN1	Q16799	776 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	METTL7B	Q6UX53	244 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RECQL-208	ENST00000542432	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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