RNA–Protein interactions for RNA: YOR156C

NFI1, Transcript of SUMO E3 ligase, yeast

Gene NFI1, Length 2,181 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NFI1	YOR156C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	MRS3	P10566	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
NFI1	YOR156C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	VHC1	P38329	1120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	RRT2	P38332	387 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	CIK1	Q01649	594 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	MDM30	Q05930	598 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	VAM3	Q12241	283 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NFI1	YOR156C	SIN4	P32259	974 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	RIM2	P38127	377 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	ACL4	Q03771	387 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	ICT1	Q12385	394 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	HIR2	P32480	875 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	TRS65	P32893	560 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	SLM4	P38247	162 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	ECM27	P47144	725 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	VPS9	P54787	451 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	MMR1	Q06324	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	BZZ1	P38822	633 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
NFI1	YOR156C	CUL3	P53202	744 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	IRC15	Q02733	499 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	HSP31	Q04432	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	YCR022C	P25620	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	KRE2	P27809	442 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	TMT1	P32643	299 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	GPM3	Q12326	303 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	HIP1	P06775	603 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	IKS1	P47042	667 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	HOT1	Q03213	719 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	EXO70	P19658	623 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	SER3	P40054	469 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	NUP53	Q03790	475 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	URA4	P20051	364 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	CBP4	P37267	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	SAS2	P40963	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	VPS74	Q06385	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	UAF30	Q08747	228 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	HSP42	Q12329	375 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	CTF3	Q12748	733 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	RHB1	P25378	209 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	BEM1	P29366	551 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	VPS54	Q12071	889 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	SPO7	P18410	259 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	CLN1	P20437	546 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	REC114	P32841	428 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	LCB2	P40970	561 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	TRS85	P46944	698 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	YGR111W	P53265	400 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	MNE1	P24720	663 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	ATS1	P31386	333 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	FRE2	P36033	711 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	SAD1	P43589	448 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	GWT1	P47026	490 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	TOM22	P49334	152 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	ARK1	P53974	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	GYL1	Q04322	720 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	BRF1	P29056	596 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	NDC1	P32500	655 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	HAT2	P39984	401 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	YJL070C	P40361	888 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	GCD10	P41814	478 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	RCF1	Q03713	159 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
NFI1	YOR156C	SCEI	P03882	235 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFI1	YOR156C	BLI1	P35727	113 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFI1	YOR156C	JEM1	P40358	645 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFI1	YOR156C	RTT101	P47050	842 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFI1	YOR156C	DAP1	Q12091	152 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NFI1	YOR156C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NFI1	YOR156C	PTR2	P32901	601 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NFI1	YOR156C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NFI1	YOR156C	MMS4	P38257	691 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NFI1	YOR156C	DSL1	P53847	754 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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