RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	KAR1	P11927	433 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TFB1	P32776	642 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	SPO23	P33757	523 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YBR241C	P38142	488 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YAL037W	P39728	267 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	ECM10	P39987	644 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	APQ12	P40532	138 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	MNT3	P40549	630 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY4A-J	P47023	414 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	SGF73	P53165	657 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	UGO1	Q03327	502 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	COS7	Q07788	383 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.49	□□□□□ -0.73	not detected
DDR2	YOL052C-A	YOL159C	Q08300	171 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	MSB2	P32334	1306 aa		10.49	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YPR096C	O13587	100 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	CLB3	P24870	427 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	PEX6	P33760	1030 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	WSC4	P38739	605 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YHR218W	P38899	603 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	FAA2	P39518	744 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YJR142W	P47173	342 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	MFG1	Q07684	458 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YOL131W	Q08270	108 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	HAL9	Q12180	1030 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-F	P0CX61	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	PPH21	P23594	369 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-C	P25383	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	MEI5	P32489	222 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	SKG1	P36169	355 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	PIM1	P36775	1133 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	CBP4	P37267	147 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	MAD2	P40958	196 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	ZIM17	P42844	174 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YNL095C	P53932	642 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YPL071C	Q02864	156 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YKU80	Q04437	629 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	SWF1	Q04629	336 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	PFA4	Q12006	378 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-B	Q12260	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	GPR1	Q12361	961 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	SNF8	Q12483	233 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	RED1	P14291	827 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	RRN10	P38204	145 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	ELO1	P39540	310 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	SDT1	P53078	280 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	HOT1	Q03213	719 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	TRM82	Q03774	444 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YML053C	Q04978	212 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	YFT2	Q06676	274 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	GYP1	Q08484	637 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	MLH3	Q12083	715 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDR2	YOL052C-A	CMP2	P14747	604 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	CMK2	P22517	447 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	PET127	P32606	800 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	YHL012W	P38709	493 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	RGA1	P39083	1007 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	MTW1	P39731	289 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	AZF1	P41696	914 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	MUP1	P50276	574 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	YNR068C	P53754	272 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	SWS2	P53937	143 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	PEX12	Q04370	399 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	ROY1	Q04847	553 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	YOR114W	Q12219	294 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	UNG1	P12887	359 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	DAP2	P18962	818 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	ADE1	P27616	306 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	CTS1	P29029	562 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	CDC5	P32562	705 aa		10.44	□□□□□ -0.74
DDR2	YOL052C-A	SEC17	P32602	292 aa		10.44	□□□□□ -0.74

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