RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	AXL2	P38928	823 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	HXT7	P39004	570 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MNN1	P39106	762 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	CAB2	P40506	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	EFM4	P40516	257 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	ECO1	P43605	281 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MET12	P46151	657 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	STE24	P47154	453 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RIM8	P53179	542 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	UBX3	Q12229	455 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RAD1	P06777	1100 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	PEP5	P12868	1029 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	SPS100	P13130	326 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MAK32	P23060	363 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	PTC6	P25646	442 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	PTM1	P32857	523 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MDJ1	P35191	511 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	CBP4	P37267	147 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RKM3	P38222	552 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MAD2	P40958	196 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	ALF1	P53904	254 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	APC4	Q04601	652 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	GLO2	Q05584	274 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	FRA1	Q07825	749 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	VPS33	P20795	691 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MLS1	P30952	554 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RSM22	P36056	628 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
YNL057W	YNL057W	MUP3	P38734	546 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	GIP2	P40036	548 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	EMP65	P40085	556 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	SEC9	P40357	651 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	CEP3	P40969	608 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	IRC6	P43615	237 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
YNL057W	YNL057W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MUP1	P50276	574 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MKC7	P53379	596 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	ALG12	P53730	551 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	CUZ1	P53899	274 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	BOP3	P53958	396 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	VPS16	Q03308	798 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RSC2	Q06488	889 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	MCH5	Q08777	521 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	ACM1	Q08981	209 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	PUS9	Q12069	462 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	TRX3	P25372	127 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	SPS22	P25380	463 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	STP22	P25604	385 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	ERG9	P29704	444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	NUP120	P35729	1037 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	FRT2	P39734	528 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	HOS4	P40480	1083 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	YGR067C	P53243	804 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	SPO20	Q04359	397 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RAD34	Q06665	692 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	REX4	Q08237	289 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	REX3	Q12090	404 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RUP1	Q12242	671 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	DYN1	P36022	4092 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL057W	YNL057W	CKI1	P20485	582 aa		4.11	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.8 ms