RNA–Protein interactions for RNA: YLR345W

YLR345W, Transcript of Similar to 6-phosphofructo-2-kinase enzymes, yeast

Gene YLR345W, Length 1,530 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR345W	YLR345W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	MMR1	Q06324	491 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	ATG29	Q12092	213 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	TYR1	P20049	452 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	ERV1	P27882	189 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	TRS65	P32893	560 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	PCH2	P38126	564 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	RIM2	P38127	377 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YDR089W	P38966	869 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	FAR3	P46671	204 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	SHE4	P51534	789 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YGR111W	P53265	400 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	SSK1	Q07084	712 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
YLR345W	YLR345W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	PHO91	P27514	894 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	SNC1	P31109	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	SRB2	P34162	210 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YBR144C	P34215	104 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	CMC1	P36064	111 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	LAG1	P38703	411 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
YLR345W	YLR345W	AGX1	P43567	385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	PTR3	P43606	678 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	MLC1	P53141	149 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	BUD32	P53323	261 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	SOV1	Q04748	898 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	VTA1	Q06263	330 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YPT6	Q99260	215 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	ISN1	Q99312	450 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	MRS3	P10566	314 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	BOS1	P25385	244 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	NTG1	P31378	399 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	SEF1	P34228	1148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	MRPL40	P36534	297 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	ICS2	P38284	255 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	WSS1	P38838	269 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YIL089W	P40500	205 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	DOT5	P40553	215 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	TWF1	P53250	332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YGR127W	P53275	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	DUG3	P53871	357 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	RHO4	Q00246	291 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	DON1	Q05610	365 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	COQ9	Q05779	260 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	VPS38	Q05919	439 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	DCI1	Q08558	271 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	AVL9	Q12500	764 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLR345W	YLR345W	PET123	P17558	318 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RTT107	P38850	1070 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	SNG1	P46950	547 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ALT2	P52892	507 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	VID30	P53076	958 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	TOF2	Q02208	771 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	THI20	Q08224	551 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	DAP1	Q12091	152 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ARP6	Q12509	438 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	CHD1	P32657	1468 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	COY1	P34237	679 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YSW1	P38280	609 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YJL070C	P40361	888 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	CHS6	P40955	746 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	KEL2	P50090	882 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	IPI3	P53877	555 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	ELO2	P25358	347 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YLR345W	YLR345W	RAD51	P25454	400 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.1 ms