RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	VHS2	P40463	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	POP1	P41812	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	GUF1	P46943	645 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	EOS1	P53938	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	BET4	Q00618	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SLD5	Q03406	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	IVY1	Q04934	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MDM30	Q05930	598 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
RPS31	YLR167W	MTR10	Q99189	972 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	VPS17	P32913	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ECM15	P35195	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MIC60	P36112	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	FAU1	P40099	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	PCI8	P40512	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MDV1	P47025	714 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	PHO92	Q06390	306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	BSC1	Q12140	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	UBX3	Q12229	455 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SCEI	P03882	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	BEM1	P29366	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ACH1	P32316	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	EFM2	P38347	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YER130C	P39959	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
RPS31	YLR167W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	STP1	Q00947	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	HSP31	Q04432	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	PGC1	Q08959	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	RHB1	P25378	209 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MGR1	P25573	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	PPZ1	P26570	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	RAD24	P32641	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YGL082W	P53155	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MLH2	Q07980	695 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	EXO70	P19658	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	PTP1	P25044	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	BUB3	P26449	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ASK1	P35734	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	DAD2	P36162	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SAS2	P40963	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	MLC1	P53141	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	SYO1	Q07395	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YEH2	Q07950	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	FRE6	Q12473	712 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	HNM1	P19807	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YIL152W	P40455	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YIR014W	P40570	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YIR016W	P40572	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	OCA2	P53949	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	BUG1	Q12191	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	RKM5	Q12367	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS31	YLR167W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	SEC62	P21825	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	MSP1	P28737	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	FRE1	P32791	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	BTN2	P53286	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	DSL1	P53847	754 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	TAF12	Q03761	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	NDL1	Q06568	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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