RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YJL132W	P47014	750 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	FMS1	P50264	508 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	VPS20	Q04272	221 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	MDM36	Q06820	579 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PDE2	P06776	526 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	TUP1	P16649	713 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PET18	P25362	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	BOS1	P25385	244 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	DOA4	P32571	926 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	COT1	P32798	439 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	MRPL37	P36532	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YBR053C	P38235	358 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	SIC1	P38634	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	BZZ1	P38822	633 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	LNP1	P38878	278 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	TVP23	P38962	199 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	SEC9	P40357	651 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	INA22	P40576	216 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ELP2	P42935	788 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	EFM3	P47163	339 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	COS5	P47187	383 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YGL242C	P53066	181 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	SEG1	Q04279	960 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	BCP1	Q06338	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ARR1	Q06596	294 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	COS7	Q07788	383 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	FRE3	Q08905	711 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	RBD2	Q12270	262 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ECM3	Q99252	613 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PEX1	P24004	1043 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ADH7	P25377	361 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YCR061W	P25639	631 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	FUB1	P25659	250 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	KKQ8	P36004	724 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	TUL1	P36096	758 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	GEX2	P36173	615 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PIM1	P36775	1133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	BUR6	P40096	142 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YJL070C	P40361	888 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	SDS3	P40505	327 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YGR127W	P53275	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	IPI3	P53877	555 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ACL4	Q03771	387 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	HOF1	Q05080	669 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	GSH2	Q08220	491 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	RLM1	Q12224	676 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	MED4	Q12343	284 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ECM29	P38737	1868 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	KSS1	P14681	368 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	COQ1	P18900	473 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	URA4	P20051	364 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	SNT1	P25357	1226 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	RDS1	P25611	832 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PPZ1	P26570	692 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YME1	P32795	747 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	THI2	P38141	450 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	MMS4	P38257	691 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PEX32	P38292	413 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	RFC3	P38629	340 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PET100	P38958	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	FAR3	P46671	204 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	STB2	P46679	850 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	NRG1	Q03125	231 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	ARR3	Q06598	404 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	YFT2	Q06676	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	PDR18	P53756	1333 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	FAB1	P34756	2278 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	VPS63	O13549	108 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	STE3	P06783	470 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PIR3	YKL163W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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