RNA–Protein interactions for RNA: YHR148W

IMP3, Transcript of Component of the SSU processome, yeast

Gene IMP3, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IMP3	YHR148W	ALG8	P40351	577 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	GCD10	P41814	478 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	URB2	P47108	1174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	SIL1	Q08199	421 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	SPS4	P09937	338 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	ELP2	P42935	788 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	CTF3	Q12748	733 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	CYB2	P00175	591 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	ATR1	P13090	542 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	CLB3	P24870	427 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	SNT1	P25357	1226 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	RML2	P32611	393 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	NIP100	P33420	868 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	BYE1	P36106	594 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	WSC2	P53832	503 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	VTA1	Q06263	330 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	SFI1	Q12369	946 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	ISN1	Q99312	450 aa		4.11	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	VTC2	P43585	828 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	TRS85	P46944	698 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	AVT4	P50944	713 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	SOV1	Q04748	898 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	RIP1	P08067	215 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	CBP4	P37267	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	YHR218W	P38899	603 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	HCS1	P34243	683 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	RSM22	P36056	628 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	RRT5	P43607	289 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	PIR3	Q03180	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	SPC19	Q03954	165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	SEC63	P14906	663 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YCR100C	P25606	316 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	NDI1	P32340	513 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	GYP6	P32806	458 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	PCA1	P38360	1216 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	IDP2	P41939	412 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	CHS1	P08004	1131 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	RPC53	P25441	422 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YCR041W	P37265	110 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	VHC1	P38329	1120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	FMS1	P50264	508 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	POP6	P53218	158 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	PCP1	P53259	346 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	CLC1	P17891	233 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YCR051W	P25631	222 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	CPR3	P25719	182 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	ADK2	P26364	225 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	REC114	P32841	428 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YME2	P32843	850 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	STB6	P36085	766 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	SAS2	P40963	338 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	PNG1	Q02890	363 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	HSP31	Q04432	237 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	ROY1	Q04847	553 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	MDM30	Q05930	598 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	HIP1	P06775	603 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	PDX1	P16451	410 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	GEX1	P25596	615 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	SIN4	P32259	974 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	ECM25	P32525	599 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	ARA1	P38115	344 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	RFC3	P38629	340 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	SSU1	P41930	458 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	YIP1	P53039	248 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	BOR1	P53838	576 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	ODC1	Q03028	310 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	HNT3	Q08702	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	VAM3	Q12241	283 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IMP3	YHR148W	PMR1	P13586	950 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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