RNA–Protein interactions for RNA: YBR279W

PAF1, Transcript of Component of the Paf1p complex involved in transcription elongation, yeast

Gene PAF1, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAF1	YBR279W	PMU1	P36069	295 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	TUL1	P36096	758 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YJL132W	P47014	750 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	AYT1	Q12226	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	PPH22	P23595	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	ARA1	P38115	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	VHC1	P38329	1120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	RPR2	P40571	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YDL186W	P48568	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	PNG1	Q02890	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
PAF1	YBR279W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	THI2	P38141	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	HAT2	P39984	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	RTT103	Q05543	409 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	NDI1	P32340	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	COS10	P52924	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	CAF40	P53829	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	HSP31	Q04432	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YCR051W	P25631	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	NIP100	P33420	868 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YGL138C	P53122	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	MUM3	Q08750	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	RKM5	Q12367	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YCR100C	P25606	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YIM1	P28625	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	DBF4	P32325	704 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	RML2	P32611	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	SSN8	P47821	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	ODC1	Q03028	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	CTF3	Q12748	733 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	PDX1	P16451	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YCR022C	P25620	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	ATS1	P31386	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YME2	P32843	850 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	IDP2	P41939	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	ECM27	P47144	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	COS5	P47187	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	PIR3	Q03180	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	DON1	Q05610	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	COS7	Q07788	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	SIL1	Q08199	421 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	RIP1	P08067	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	CPR3	P25719	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YHR054C	P38780	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	HEM2	P05373	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	TFB1	P32776	642 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YFL067W	P43537	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	POP6	P53218	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	PCP1	P53259	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	SKO1	Q02100	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	REX4	Q08237	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	ECM25	P32525	599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	AVT4	P50944	713 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YIP1	P53039	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	MRP51	Q02950	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	ROY1	Q04847	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	VAM3	Q12241	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	ISA2	Q12425	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	AFI1	Q99222	893 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	ADK2	P26364	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	AGA1	P32323	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	MRP4	P32902	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	PIM1	P36775	1133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1	YBR279W	YCR041W	P37265	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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