RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)G

tF(GAA)G, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)G, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)GtF(GAA)G CDC12P32468 407 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YKL091CP33324 310 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SKT5P34226 696 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SOR1P35497 357 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G GLG1P36143 616 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YHL041WP38730 149 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PHO90P39535 881 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YER184CP39961 794 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SOK1P40317 901 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G IDP2P41939 412 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YFR035CP43608 114 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ROK1P45818 564 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RPA43P46669 326 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G STB2P46679 850 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SNG1P46950 547 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G CSN12P47130 423 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PGU1P47180 361 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G GCV1P48015 400 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MSY1P48527 492 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G BIO3P50277 480 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SOL1P50278 321 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MND1P53102 219 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YGR066CP53242 292 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G BUD32P53323 261 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G CBK1P53894 756 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G KTR6P54070 446 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ACT1P60010 375 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SED1Q01589 338 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SKO1Q02100 647 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RPM2Q02773 1202 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G OAZ1Q02803 292 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G HOT1Q03213 719 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MMT1Q03218 510 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G HAS1Q03532 505 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MSS11Q03825 758 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G HED1Q03937 162 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ARO80Q04052 950 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PEX12Q04370 399 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PLM2Q04383 521 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MRPL1Q04599 285 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YLR446WQ06204 433 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SOR2Q07786 357 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G CMS1Q07897 291 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RSC58Q07979 502 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G THI20Q08224 551 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SLK19Q08581 821 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MCH5Q08777 521 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RDR1Q08904 546 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G TRE1Q08919 783 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YPL150WQ12152 901 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G FRE8Q12209 686 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YOR114WQ12219 294 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ICT1Q12385 394 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G DAT1P13483 248 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ENA1P13587 1091 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G CLN2P20438 545 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SAG1P20840 650 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G AIM17P23180 465 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G AAT2P23542 418 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G EMC1P25574 760 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G TAH1P25638 111 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MNS1P32906 549 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PPZ2P33329 710 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G TIF3P34167 436 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR144CP34215 104 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SNU114P36048 1008 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RPF2P36160 344 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G MRPL39P36533 70 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SDH4P37298 181 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YMC2P38087 329 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G ZTA1P38230 334 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G IFA38P38286 347 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RRT2P38332 387 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RCK1P38622 512 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YHR112CP38716 378 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G FSH1P38777 243 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G SBE22P38814 852 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PRM9P39551 298 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PRP39P39682 629 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G GET2P40056 285 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RFC4P40339 323 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G NUP82P40368 713 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YIL165CP40446 119 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PCI8P40512 444 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PRM2P40534 656 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G CIN1P40987 1014 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G AZF1P41696 914 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G BUD8P41698 603 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PFA3P42836 336 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G GZF3P42944 551 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G IRC5P43610 853 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G PRY1P47032 299 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G YJL043WP47053 257 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)GtF(GAA)G RFX1P48743 811 aa0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.9 ms