RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC12P32468 407 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YKL091CP33324 310 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SKT5P34226 696 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SOR1P35497 357 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B GLG1P36143 616 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YHL041WP38730 149 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PHO90P39535 881 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YER184CP39961 794 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SOK1P40317 901 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B IDP2P41939 412 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YFR035CP43608 114 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ROK1P45818 564 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RPA43P46669 326 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B STB2P46679 850 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SNG1P46950 547 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B CSN12P47130 423 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PGU1P47180 361 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B GCV1P48015 400 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MSY1P48527 492 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B BIO3P50277 480 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SOL1P50278 321 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MND1P53102 219 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR066CP53242 292 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B BUD32P53323 261 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B CBK1P53894 756 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B KTR6P54070 446 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ACT1P60010 375 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SED1Q01589 338 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SKO1Q02100 647 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RPM2Q02773 1202 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B OAZ1Q02803 292 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B HOT1Q03213 719 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MMT1Q03218 510 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B HAS1Q03532 505 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MSS11Q03825 758 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B HED1Q03937 162 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ARO80Q04052 950 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PEX12Q04370 399 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PLM2Q04383 521 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL1Q04599 285 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR446WQ06204 433 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SOR2Q07786 357 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B CMS1Q07897 291 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RSC58Q07979 502 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B THI20Q08224 551 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SLK19Q08581 821 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MCH5Q08777 521 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RDR1Q08904 546 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B TRE1Q08919 783 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YPL150WQ12152 901 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B FRE8Q12209 686 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR114WQ12219 294 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ICT1Q12385 394 aa0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B DAT1P13483 248 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ENA1P13587 1091 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B CLN2P20438 545 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SAG1P20840 650 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM17P23180 465 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B AAT2P23542 418 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B EMC1P25574 760 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B TAH1P25638 111 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MNS1P32906 549 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PPZ2P33329 710 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B TIF3P34167 436 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR144CP34215 104 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SNU114P36048 1008 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RPF2P36160 344 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL39P36533 70 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SDH4P37298 181 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YMC2P38087 329 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B ZTA1P38230 334 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B IFA38P38286 347 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RRT2P38332 387 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RCK1P38622 512 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR112CP38716 378 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B FSH1P38777 243 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B SBE22P38814 852 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PRM9P39551 298 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PRP39P39682 629 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B GET2P40056 285 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RFC4P40339 323 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B NUP82P40368 713 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YIL165CP40446 119 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PCI8P40512 444 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PRM2P40534 656 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B CIN1P40987 1014 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B AZF1P41696 914 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B BUD8P41698 603 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PFA3P42836 336 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B GZF3P42944 551 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B IRC5P43610 853 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B PRY1P47032 299 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL043WP47053 257 aa0.64□□□□□ -2.31
tF(GAA)BtF(GAA)B RFX1P48743 811 aa0.64□□□□□ -2.31
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