RNA–Protein interactions for RNA: YOR316C

COT1, Transcript of Vacuolar transporter that mediates zinc transport into the vacuole, yeast

Gene COT1, Length 1,320 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COT1	YOR316C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	LDB18	Q07887	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	GPB1	Q08886	897 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RAD10	P06838	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	NPP1	P25353	742 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	PCL2	P25693	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	NDI1	P32340	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	VHC1	P38329	1120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ELO3	P40319	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ATM1	P40416	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	INA22	P40576	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SSU1	P41930	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SIP4	P46954	829 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YJR030C	P47101	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	SWC4	P53201	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YPR003C	P53394	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	YAP6	Q03935	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RRN11	Q04712	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	RMP1	Q12530	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COT1	YOR316C	ADE8	P04161	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	EMC1	P25574	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	ATG15	P25641	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	AFR1	P33304	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	NUP120	P35729	1037 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	ALY1	P36117	915 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	SMF2	P38778	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	STN1	P38960	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	RPH1	P39956	796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	SCC4	P40090	624 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	ALY2	P47029	1046 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	YGR012W	P53206	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	VAC7	P53950	1165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	EFM6	P53970	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	RCF1	Q03713	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	TRM8	Q12009	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	NUR1	Q12066	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	HUA2	Q12134	243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	URA4	P20051	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	MGT1	P26188	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	CDC20	P26309	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	EMC3	P36039	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	MRPL37	P36532	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	IML3	P38265	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	SIT1	P39980	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	RGI2	P40188	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	ERR3	P42222	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	MEP3	P53390	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	ARP4	P80428	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	GAD1	Q04792	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	ARP9	Q05123	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	ADY3	Q07732	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	IMA2	Q08295	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	COX5A	P00424	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	PEP5	P12868	1029 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	RPO26	P20435	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	GDA1	P32621	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	BEM3	P32873	1128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	SKN1	P33336	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	CTF13	P35203	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	GPI16	P38875	610 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	SAE2	P46946	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	ATG23	Q06671	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	TGL5	Q12043	749 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	LDB17	Q12342	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COT1	YOR316C	OCA6	Q12454	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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