RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	VAM3	Q12241	283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ARG82	P07250	355 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	URA6	P15700	204 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	AMS1	P22855	1083 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SED4	P25365	1065 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TCA17	P32613	152 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YUH1	P35127	236 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	KAE1	P36132	386 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YBR032W	P38223	100 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YEN1	P40028	759 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YIR035C	P40579	254 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	IDP2	P41939	412 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YJL043W	P47053	257 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RSC9	Q03124	581 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	VPS74	Q06385	345 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	OPT2	Q06593	877 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TRE2	Q08693	809 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YPR063C	Q12160	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HOS1	Q12214	470 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	IML1	P47170	1584 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SPT3	P06844	337 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PRB1	P09232	635 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SPO11	P23179	398 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PTC6	P25646	442 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	DGR2	P32330	852 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SPT23	P35210	1082 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MRPL3	P36516	390 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MMS4	P38257	691 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	FTH1	P38310	465 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TSC10	P38342	320 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PLB1	P39105	664 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	UBP7	P40453	1071 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MSS2	P40990	351 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ASK10	P48361	1146 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	IMA1	P53051	589 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SLD3	P53135	668 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TUB4	P53378	473 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YNR061C	P53747	219 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	OST6	Q03723	332 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ECI1	Q05871	280 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	FMP45	Q07651	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RRT8	Q08219	342 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TGS1	Q12052	315 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PCD1	Q12524	340 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	DAL81	P21657	970 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HYM1	P32464	399 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SIP1	P32578	815 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	UTR4	P32626	227 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MSN4	P33749	630 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	OAR1	P35731	278 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
EXO1	YOR033C	COS8	P38723	381 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	LSB6	P42951	607 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TPN1	P53099	579 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PEX13	P80667	386 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YCL001W-A	P87012	153 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	AGE1	Q04412	482 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TFC6	Q06339	672 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ATG20	Q07528	640 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RFU1	Q08003	200 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YOL107W	Q12239	342 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SVS1	Q12254	260 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YPR015C	Q12531	247 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ADR1	P07248	1323 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	DST1	P07273	309 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	IMA3	P0CW40	589 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	IMA4	P0CW41	589 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	IMG1	P25626	169 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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