RNA–Protein interactions for RNA: YHR104W

GRE3, Transcript of Aldose reductase, yeast

Gene GRE3, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRE3	YHR104W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	HST1	P53685	503 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SWF1	Q04629	336 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SPH1	Q06160	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PIG1	Q06216	648 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YFH1	Q07540	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PUS9	Q12069	462 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RIP1	P08067	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	DAP2	P18962	818 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SPC110	P32380	944 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	BNA4	P38169	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	UBA4	P38820	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	CHS7	P38843	316 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YER130C	P39959	443 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SHE4	P51534	789 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ASI1	P54074	624 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SHR3	Q02774	210 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	UBX3	Q12229	455 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	SNF3	P10870	884 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RPB8	P20436	146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	OAR1	P35731	278 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	CBP4	P37267	147 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	ROT2	P38138	954 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PFF1	P38244	976 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	MLH1	P38920	769 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	GND2	P53319	492 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	YNR068C	P53754	272 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
GRE3	YHR104W	MDY2	Q12285	212 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GRE3	YHR104W	PEP5	P12868	1029 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	PMR1	P13586	950 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SPO11	P23179	398 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	DAL80	P26343	269 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	BEM1	P29366	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	NDI1	P32340	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SRB2	P34162	210 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	STV1	P37296	890 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ARP1	P38696	384 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	LAG1	P38703	411 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	PAC2	P39937	518 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	AQR1	P53943	586 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SMA1	Q02651	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ARP10	Q04549	284 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	NDL1	Q06568	189 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	BSP1	Q06604	576 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ATP10	P18496	279 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	CNA1	P23287	553 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SIN4	P32259	974 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SUR1	P33300	382 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	DUG2	P38149	878 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	MOH1	P38191	138 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RTT105	P40063	208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	OSW5	P40219	148 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ARP5	P53946	755 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	TPO3	Q06451	622 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SRN2	Q99176	213 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	TYR1	P20049	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RHB1	P25378	209 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	GEX1	P25596	615 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SNC1	P31109	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	MSN2	P33748	704 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	EFM2	P38347	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	POP1	P41812	875 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YJR154W	P47181	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	OCA2	P53949	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	FMP30	Q02883	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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