RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	AGP2	P38090	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	LDB7	P38210	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MEP2	P41948	499 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YGR035C	P53222	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YNL115C	P53925	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	VID22	Q05934	901 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RKM5	Q12367	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MSW1	P04803	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ACP1	P32463	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PEX6	P33760	1030 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	COS111	P38308	924 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RIM4	P38741	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ATM1	P40416	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YGR201C	P42936	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	COQ6	P53318	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	GRX3	Q03835	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	NPR1	P22211	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MRPL8	P22353	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YCR099C	P25657	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SEC61	P32915	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	CAF4	P36130	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MAM33	P40513	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YNL033W	P53964	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YNL019C	P53975	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RSC9	Q03124	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YUR1	P26725	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ULI1	P43604	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MON1	P53129	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SLT2	Q00772	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TRM82	Q03774	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RSF1	Q05043	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	UBC8	P28263	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	MNN1	P39106	762 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RPH1	P39956	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PAN6	P40459	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YJR149W	P47177	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YNL011C	P53980	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	THP1	Q08231	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PEX11	Q12462	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	COX3	P00420	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SIR3	P06701	978 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	HEM15	P16622	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
YOR1	YGR281W	OXP1	P28273	1286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	NTG1	P31378	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ROT2	P38138	954 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TSC10	P38342	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PIK1	P39104	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	HTA2	P04912	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PEP7	P32609	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TPO5	P36029	618 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SLM4	P38247	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	ARN2	P38724	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SBE22	P38814	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YJL193W	P39542	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	FLC3	P53121	802 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	YSA1	Q01976	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	VPS74	Q06385	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	PSR1	Q07800	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SSH4	P32343	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	CCT6	P39079	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	LAS21	P40367	830 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	TAD1	P53065	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	SLD3	P53135	668 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOR1	YGR281W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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