RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W NCP1P16603 691 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YBR225WP38321 900 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W NIT1P40447 199 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W SSY5P47002 699 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W NAS6P50086 228 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data12.45□□□□□ -0.42not detected
SSA4YER103W NHP10Q03435 203 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YDL073WQ07454 984 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W PEX1P24004 1043 aa12.44□□□□□ -0.42
SSA4YER103W GRR1P24814 1151 aa12.44□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YJL007CP47080 104 aa12.44□□□□□ -0.42
SSA4YER103W MET14Q02196 202 aa12.44□□□□□ -0.42
SSA4YER103W RSC4Q02206 625 aa12.44□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YPL034WQ03083 165 aa12.44□□□□□ -0.42
SSA4YER103W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
SSA4YER103W SEC53P07283 254 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YEL028WP39989 153 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W FKH2P41813 862 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W BLS1Q06071 122 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W VTA1Q06263 330 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W AAD4Q07747 329 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W MCD1Q12158 566 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YLR126CQ12288 251 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W PNS1Q12412 539 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W HTA2P04912 132 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W DBP2P24783 546 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W IXR1P33417 597 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YHR045WP38775 560 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W SIW14P53965 281 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YPL071CQ02864 156 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YMR010WQ03687 405 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W LAG2Q92325 660 aa12.43□□□□□ -0.42
SSA4YER103W SGV1P23293 657 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W JEN1P36035 616 aa12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W FSH1P38777 243 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data12.42□□□□□ -0.42not detected
SSA4YER103W RSP5P39940 809 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W HXT16P47185 567 aa12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YPT32P51996 222 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W SPO20Q04359 397 aa12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W THP1Q08231 455 aa12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W FEX1Q08913 375 aa12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ALG7P07286 448 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W DBP3P20447 523 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W SDH2P21801 266 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YBR137WP38276 179 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W PRM9P39551 298 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ESL1P40456 1118 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W SCW11P53189 542 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W PDR8Q06149 701 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W PKC1P24583 1151 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W PEX34P25584 144 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W PER1P25625 357 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W RNP1P32385 249 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W HIS7P33734 552 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data12.41□□□□□ -0.42not detected
SSA4YER103W GOT1Q03554 138 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W DXO1Q06349 442 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W MFG1Q07684 458 aa12.41□□□□□ -0.42
SSA4YER103W FPS1P23900 669 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W DUN1P39009 513 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W EXO1P39875 702 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W VAB2P40003 282 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W AYR1P40471 297 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W RPS12P48589 143 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W PRM8P53174 237 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W HEH2Q03281 663 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ARO10Q06408 635 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W MLC2Q06580 163 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W FEX2Q08991 375 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W NUS1Q12063 375 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W MLH3Q12083 715 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W HAL9Q12180 1030 aa12.4□□□□□ -0.42
SSA4YER103W CBP1P07252 654 aa12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W PET494P07390 489 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W HXT2P23585 541 aa12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data12.39□□□□□ -0.43not detected
SSA4YER103W PLB1P39105 664 aa12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W APS3P47064 194 aa12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data12.39□□□□□ -0.43not detected
SSA4YER103W RRN5Q02983 363 aa12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W GCN5Q03330 439 aa12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W YMD8Q03697 442 aa12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W ARA2Q04212 335 aa12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W YDR109CQ04585 715 aa12.39□□□□□ -0.43
SSA4YER103W RSC3Q06639 885 aa12.39□□□□□ -0.43
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