RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W GIP4P39732 760 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W CCT7P42943 550 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YML6P51998 286 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W DRN1P53255 507 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W IST1P53843 298 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W ERO1Q03103 563 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W RAD30Q04049 632 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W YDL242WQ07746 117 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data5.47□□□□□ -1.53 RIP-Chip
VHS1YDR247W ERP4Q12450 207 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W FLO11P08640 1367 aa5.47□□□□□ -1.53
VHS1YDR247W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W RFA2P26754 273 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W VPH2P32341 215 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W MUD1P32605 298 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W UBP11P36026 717 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W YBL028CP38202 106 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W MIT1P40002 666 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W SLZ1P40167 298 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W MKT1P40850 830 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W IRC6P43615 237 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W UBX6P47049 396 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W MIG2P53035 382 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W YGR016WP53209 190 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W MUB1Q03162 620 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W MFB1Q04922 465 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W BAG7Q12128 409 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W GRX6Q12438 231 aa5.46□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W GCN4P03069 281 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W SUI3P09064 285 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W TCP1P12612 559 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W URA4P20051 364 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W RRT12P25381 491 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W SRB5P32585 307 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W GDA1P32621 518 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W CSG2P35206 410 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W YMC2P38087 329 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W MRX3P38172 270 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W PCA1P38360 1216 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W MSR1P38714 643 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W ERC1P38767 581 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W TRM5P38793 499 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W AIM20P40451 204 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W FIS1P40515 155 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W IAH1P41734 238 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W PHO86P46956 311 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W STB4P50104 949 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W COG2P53271 262 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W BIO4P53630 237 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W CPR8P53728 308 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W IVY1Q04934 453 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W ATG17Q06410 417 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W PUS9Q12069 462 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W YDR018CQ12185 396 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W LCB4Q12246 624 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W TAF3Q12297 353 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W YOR019WQ99248 730 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W RIF1P29539 1916 aa5.45□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W COX1P00401 534 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W PGK1P00560 416 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W TPK2P06245 380 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W NAT1P12945 854 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W SNT1P25357 1226 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W MRPL9P31334 269 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W GYP6P32806 458 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W CUE2P36075 443 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W ETR1P38071 380 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W TSC10P38342 320 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W IME4P41833 600 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W SAE2P46946 345 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W CPR7P47103 393 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W LSC1P53598 329 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W ARE2P53629 642 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W YDR476CQ03362 224 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W PRM6Q04705 352 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W YML053CQ04978 212 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W ADE13Q05911 482 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W ORM2Q06144 216 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W GPM3Q12326 303 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W SPE4Q12455 300 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa5.44□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W BI2P03873 423 aa5.43□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W RPS3P05750 240 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W CDC43P18898 376 aa5.43□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W KIN3P22209 435 aa5.43□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W YCK1P23291 538 aa5.43□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W DMC1P25453 334 aa5.43□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W RAD14P28519 371 aa5.43□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W KAR9P32526 644 aa5.43□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W SIP2P34164 415 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
VHS1YDR247W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data5.43□□□□□ -1.54not detected
VHS1YDR247W DIM1P41819 318 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
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