RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeastyeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPR4YLR449W RTG3P38165 486 aa17.07■□□□□ 0.32
FPR4YLR449W IOC4Q04213 475 aa17.07■□□□□ 0.32
FPR4YLR449W YML133CQ03099 1374 aa17.06■□□□□ 0.32
FPR4YLR449W YLL067CQ07888 1374 aa17.06■□□□□ 0.32
FPR4YLR449W YLL066CQ99208 1374 aa17.06■□□□□ 0.32
FPR4YLR449W YMR196WQ04336 1088 aa17.05■□□□□ 0.32
FPR4YLR449W NST1P53935 1240 aa17.02■□□□□ 0.32
FPR4YLR449W RCM1P53972 490 aa17.02■□□□□ 0.32
FPR4YLR449W CPS1P27614 576 aa17.01■□□□□ 0.31
FPR4YLR449W LEU3P08638 886 aa17■□□□□ 0.31
FPR4YLR449W PPH3P32345 308 aa17■□□□□ 0.31
FPR4YLR449W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
FPR4YLR449W PRS1P32895 427 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
FPR4YLR449W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
FPR4YLR449W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
FPR4YLR449W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
FPR4YLR449W TAP42Q04372 366 aa16.9■□□□□ 0.3
FPR4YLR449W USO1P25386 1790 aa16.89■□□□□ 0.3
FPR4YLR449W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
FPR4YLR449W PRP43P53131 767 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
FPR4YLR449W RPP0P05317 312 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
FPR4YLR449W TRK1P12685 1235 aa16.82■□□□□ 0.28
FPR4YLR449W PDI1P17967 522 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
FPR4YLR449W THI12P42883 340 aa16.82■□□□□ 0.28
FPR4YLR449W THI5P43534 340 aa16.82■□□□□ 0.28
FPR4YLR449W THI11P47183 340 aa16.82■□□□□ 0.28
FPR4YLR449W THI13Q07748 340 aa16.82■□□□□ 0.28
FPR4YLR449W GRX4P32642 244 aa16.79■□□□□ 0.28
FPR4YLR449W RTF1P53064 558 aa16.77■□□□□ 0.28
FPR4YLR449W AUS1Q08409 1394 aa16.75■□□□□ 0.27
FPR4YLR449W VPS27P40343 622 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
FPR4YLR449W KAR2P16474 682 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
FPR4YLR449W CDC45Q08032 650 aa16.71■□□□□ 0.27
FPR4YLR449W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
FPR4YLR449W CSE4P36012 229 aa16.67■□□□□ 0.26
FPR4YLR449W NOP2P40991 618 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
FPR4YLR449W HIM1Q06674 414 aa16.67■□□□□ 0.26
FPR4YLR449W YDL144CQ07589 356 aa16.67■□□□□ 0.26
FPR4YLR449W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
FPR4YLR449W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
FPR4YLR449W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
FPR4YLR449W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
FPR4YLR449W SNF2P22082 1703 aa16.62■□□□□ 0.25
FPR4YLR449W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
FPR4YLR449W PTP3P40048 928 aa16.59■□□□□ 0.25
FPR4YLR449W MPP10P47083 593 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
FPR4YLR449W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
FPR4YLR449W PRD1P25375 712 aa16.55■□□□□ 0.24
FPR4YLR449W PAP2P53632 584 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
FPR4YLR449W GAS4Q08271 471 aa16.55■□□□□ 0.24
FPR4YLR449W DPS1P04802 557 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
FPR4YLR449W SUI2P20459 304 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
FPR4YLR449W TY4B-HP0C2J7 1802 aa16.52■□□□□ 0.24
FPR4YLR449W TY4B-JP47024 1803 aa16.52■□□□□ 0.24
FPR4YLR449W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
FPR4YLR449W YRF1-2P40105 1681 aa16.5■□□□□ 0.23
FPR4YLR449W APC1P53886 1748 aa16.49■□□□□ 0.23
FPR4YLR449W THI22Q06490 572 aa16.49■□□□□ 0.23
FPR4YLR449W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data16.47■□□□□ 0.23not detected
FPR4YLR449W YRF1-4O13559 1382 aa16.47■□□□□ 0.23
FPR4YLR449W SAP155P43612 1002 aa16.46■□□□□ 0.23
FPR4YLR449W SLM3Q12093 417 aa16.46■□□□□ 0.23
FPR4YLR449W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
FPR4YLR449W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
FPR4YLR449W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
FPR4YLR449W SIR4P11978 1358 aa16.42■□□□□ 0.22
FPR4YLR449W DSD1P53095 428 aa16.41■□□□□ 0.22
FPR4YLR449W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data16.4■□□□□ 0.22not detected
FPR4YLR449W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W TPD3P31383 635 aa16.39■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W CTF4Q01454 927 aa16.38■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W YNL050CP53952 270 aa16.37■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W TFA1P36100 482 aa16.36■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W RTT109Q07794 436 aa16.36■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W YIL177CP40434 1758 aa16.36■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W YJL225CP40889 1758 aa16.36■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W NTH2P35172 780 aa16.34■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W TCB1Q12466 1186 aa16.34■□□□□ 0.21
FPR4YLR449W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W MAM1P40065 302 aa16.31■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W RSF2P46974 1380 aa16.3■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data16.29■□□□□ 0.2not detected
FPR4YLR449W RAD2P07276 1031 aa16.28■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W XKS1P42826 600 aa16.28■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W FKS3Q04952 1785 aa16.28■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W YIL092WP40497 633 aa16.27■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W GYP7P48365 746 aa16.27■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W URB1P34241 1764 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
FPR4YLR449W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
FPR4YLR449W AOS1Q06624 347 aa16.26■□□□□ 0.19
FPR4YLR449W EDE1P34216 1381 aa16.26■□□□□ 0.19
FPR4YLR449W REB1P21538 810 aa16.25■□□□□ 0.19
FPR4YLR449W HSP104P31539 908 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
FPR4YLR449W RCR1P38212 213 aa16.24■□□□□ 0.19
FPR4YLR449W FPR3P38911 411 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FPR4YLR449W ENT1Q12518 454 aa16.24■□□□□ 0.19
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