RNA–Protein interactions for RNA: YJR012C

YJR012C, Transcript of Essential protein of unknown function, yeastyeast

Gene YJR012C, Length 624 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJR012CYJR012C GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
YJR012CYJR012C RTG1P32607 177 aa7.66□□□□□ -1.18
YJR012CYJR012C NCR1Q12200 1170 aa7.66□□□□□ -1.18
YJR012CYJR012C THI12P42883 340 aa7.64□□□□□ -1.19
YJR012CYJR012C THI5P43534 340 aa7.64□□□□□ -1.19
YJR012CYJR012C THI11P47183 340 aa7.64□□□□□ -1.19
YJR012CYJR012C THI13Q07748 340 aa7.64□□□□□ -1.19
YJR012CYJR012C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
YJR012CYJR012C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
YJR012CYJR012C SSP1P38871 571 aa7.57□□□□□ -1.2
YJR012CYJR012C EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
YJR012CYJR012C OXP1P28273 1286 aa7.55□□□□□ -1.2
YJR012CYJR012C YMR196WQ04336 1088 aa7.55□□□□□ -1.2
YJR012CYJR012C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YJR012CYJR012C MSB4Q12317 492 aa7.53□□□□□ -1.2
YJR012CYJR012C APP1P53933 587 aa7.52□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C SEC61P32915 480 aa7.51□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C URN1Q06525 465 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.5□□□□□ -1.21not detected
YJR012CYJR012C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C HAP1P0CE41 1502 aa7.48□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C CKB1P43639 278 aa7.48□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C IML1P47170 1584 aa7.48□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C IFH1P39520 1085 aa7.47□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C YBT1P32386 1661 aa7.47□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
YJR012CYJR012C PIB1Q06651 286 aa7.43□□□□□ -1.22
YJR012CYJR012C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
YJR012CYJR012C SAP30P38429 201 aa7.41□□□□□ -1.22
YJR012CYJR012C XDJ1P39102 459 aa7.41□□□□□ -1.22
YJR012CYJR012C CAT8P39113 1433 aa7.4□□□□□ -1.22
YJR012CYJR012C VMR1P38735 1592 aa7.39□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C IPL1P38991 367 aa7.39□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C BBC1P47068 1157 aa7.39□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C RSM7P47150 247 aa7.39□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C YMR074CQ04773 145 aa7.39□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C YLR271WQ06152 274 aa7.38□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C TYS1P36421 394 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C DMA1P38823 416 aa7.37□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C SET4P42948 560 aa7.37□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C PRE3P38624 215 aa7.36□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C YOL036WQ08206 761 aa7.35□□□□□ -1.23
YJR012CYJR012C RRD1P40454 393 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YJR012CYJR012C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
YJR012CYJR012C VRP1P37370 817 aa7.3□□□□□ -1.24
YJR012CYJR012C BCK1Q01389 1478 aa7.3□□□□□ -1.24
YJR012CYJR012C PDR11P40550 1411 aa7.29□□□□□ -1.24
YJR012CYJR012C MGA2P40578 1113 aa7.29□□□□□ -1.24
YJR012CYJR012C TAF7Q05021 590 aa7.29□□□□□ -1.24
YJR012CYJR012C ENT1Q12518 454 aa7.26□□□□□ -1.25
YJR012CYJR012C AI2P03876 854 aa7.25□□□□□ -1.25
YJR012CYJR012C SRC1Q03707 834 aa7.25□□□□□ -1.25
YJR012CYJR012C YDL129WQ07555 291 aa7.25□□□□□ -1.25
YJR012CYJR012C SSA1P10591 642 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YJR012CYJR012C ENV9Q08651 330 aa7.23□□□□□ -1.25
YJR012CYJR012C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YJR012CYJR012C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C DAN4P47179 1161 aa7.2□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C KRE5P22023 1365 aa7.2□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C RIA1P53893 1110 aa7.19□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C SRB8P25648 1427 aa7.17□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C CST9Q06032 482 aa7.16□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C YBL086CP38177 466 aa7.15□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
YJR012CYJR012C MRX12P47084 519 aa7.14□□□□□ -1.27
YJR012CYJR012C YRF1-2P40105 1681 aa7.13□□□□□ -1.27
YJR012CYJR012C UBP1P25037 809 aa7.13□□□□□ -1.27
YJR012CYJR012C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
YJR012CYJR012C JIP4Q03361 876 aa7.11□□□□□ -1.27
YJR012CYJR012C LEU3P08638 886 aa7.08□□□□□ -1.28
YJR012CYJR012C RPN11P43588 306 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YJR012CYJR012C UGA2P38067 497 aa7.06□□□□□ -1.28
YJR012CYJR012C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YJR012CYJR012C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YJR012CYJR012C GCN2P15442 1659 aa7.04□□□□□ -1.28
YJR012CYJR012C MRM1P25270 412 aa7.04□□□□□ -1.28
YJR012CYJR012C LYS4P49367 693 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
YJR012CYJR012C SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
YJR012CYJR012C YDR344CQ05510 147 aa7.01□□□□□ -1.29
YJR012CYJR012C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
YJR012CYJR012C SAM3Q08986 587 aa7□□□□□ -1.29
YJR012CYJR012C ALD2P47771 506 aa6.98□□□□□ -1.29
YJR012CYJR012C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YJR012CYJR012C RTG3P38165 486 aa6.97□□□□□ -1.29
YJR012CYJR012C NPR2P39923 615 aa6.96□□□□□ -1.3
YJR012CYJR012C DOT5P40553 215 aa6.96□□□□□ -1.3
YJR012CYJR012C CAB1Q04430 367 aa6.96□□□□□ -1.3
YJR012CYJR012C URB1P34241 1764 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
YJR012CYJR012C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
YJR012CYJR012C NUP192P47054 1683 aa6.95□□□□□ -1.3
YJR012CYJR012C YJL181WP46987 611 aa6.94□□□□□ -1.3
YJR012CYJR012C TAF5P38129 798 aa6.93□□□□□ -1.3
YJR012CYJR012C CTH1P47976 325 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 94.7 ms