RNA–Protein interactions for RNA: YBR069C

TAT1, Transcript of Amino acid transporter for valine, leucine, isoleucine, and tyrosine, yeastyeast

Gene TAT1, Length 1,860 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAT1YBR069C TRK1P12685 1235 aa14.89□□□□□ -0.03
TAT1YBR069C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data14.89□□□□□ -0.03not detected
TAT1YBR069C MSP1P28737 362 aa14.88□□□□□ -0.03
TAT1YBR069C EDE1P34216 1381 aa14.87□□□□□ -0.03
TAT1YBR069C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TAT1YBR069C CTR9P89105 1077 aa14.85□□□□□ -0.03
TAT1YBR069C QCR6P00127 147 aa14.84□□□□□ -0.03
TAT1YBR069C SPE2P21182 396 aa14.84□□□□□ -0.03
TAT1YBR069C SCT1P32784 759 aa14.84□□□□□ -0.03
TAT1YBR069C RAD2P07276 1031 aa14.84□□□□□ -0.03
TAT1YBR069C NUP192P47054 1683 aa14.83□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C NOT3P06102 836 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C ARL1P38116 183 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C IOC4Q04213 475 aa14.82□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C VMR1P38735 1592 aa14.8□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C BNR1P40450 1375 aa14.8□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C KNS1P32350 737 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C TRM3Q07527 1436 aa14.78□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C DAL5P15365 543 aa14.78□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C YPP1P46951 817 aa14.78□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C RLF2Q12495 606 aa14.78□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C HAP1P0CE41 1502 aa14.78□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C IML1P47170 1584 aa14.77□□□□□ -0.04
TAT1YBR069C POL32P47110 350 aa14.75□□□□□ -0.05
TAT1YBR069C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TAT1YBR069C SAP155P43612 1002 aa14.74□□□□□ -0.05
TAT1YBR069C YIL092WP40497 633 aa14.73□□□□□ -0.05
TAT1YBR069C NOP58Q12499 511 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TAT1YBR069C FKH1P40466 484 aa14.72□□□□□ -0.05
TAT1YBR069C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TAT1YBR069C TEA1P47988 759 aa14.71□□□□□ -0.05
TAT1YBR069C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data14.69□□□□□ -0.06not detected
TAT1YBR069C YRF1-1P0CX20 1796 aa14.68□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C YRF1-5P0CX21 1796 aa14.68□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C YRF1-8P0CX22 1796 aa14.68□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C NAP1P25293 417 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C TPD3P31383 635 aa14.67□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C ITC1P53125 1264 aa14.66□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C YAP3P38749 330 aa14.65□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C YGR130CP53278 816 aa14.65□□□□□ -0.06
TAT1YBR069C AVT3P36062 692 aa14.63□□□□□ -0.07
TAT1YBR069C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TAT1YBR069C KRE5P22023 1365 aa14.63□□□□□ -0.07
TAT1YBR069C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TAT1YBR069C TAF8Q03750 510 aa14.61□□□□□ -0.07
TAT1YBR069C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TAT1YBR069C THI22Q06490 572 aa14.59□□□□□ -0.07
TAT1YBR069C SRS2P12954 1174 aa14.58□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C CSE4P36012 229 aa14.57□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C LCD1Q04377 747 aa14.56□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C RSC1P53236 928 aa14.55□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C MET5P47169 1442 aa14.55□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C COG8Q04632 607 aa14.55□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C PRD1P25375 712 aa14.54□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C URN1Q06525 465 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C YML133CQ03099 1374 aa14.52□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C YLL067CQ07888 1374 aa14.52□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C YLL066CQ99208 1374 aa14.52□□□□□ -0.08
TAT1YBR069C HAP5Q02516 242 aa14.52□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C DNF3Q12674 1656 aa14.5□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C SPT21P35209 758 aa14.5□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C KAR2P16474 682 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C SIR4P11978 1358 aa14.49□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C MDG1P53885 366 aa14.48□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C RTT109Q07794 436 aa14.48□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C RAD9P14737 1309 aa14.48□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C RKM3P38222 552 aa14.48□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C RAD26P40352 1085 aa14.47□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C TPM2P40414 161 aa14.47□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C ESC2Q06340 456 aa14.47□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C YRF1-4O13559 1382 aa14.46□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C PIL1P53252 339 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TAT1YBR069C BCK1Q01389 1478 aa14.45□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C MCM2P29469 868 aa14.44□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C YGL081WP53156 320 aa14.44□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C PAP2P53632 584 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C NUP145P49687 1317 aa14.44□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C TRP5P00931 707 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C DLD1P32891 587 aa14.42□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C RRT14P40470 206 aa14.4□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C ALD4P46367 519 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C RAD50P12753 1312 aa14.4□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C RPN1P38764 993 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C ILV3P39522 585 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C NPA3P47122 385 aa14.4□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
TAT1YBR069C PSK1P31374 1356 aa14.39□□□□□ -0.11
TAT1YBR069C MIC60P36112 540 aa14.38□□□□□ -0.11
TAT1YBR069C SMC3P47037 1230 aa14.38□□□□□ -0.11
TAT1YBR069C NKP2Q06162 153 aa14.38□□□□□ -0.11
TAT1YBR069C RVS167P39743 482 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
TAT1YBR069C CIR1P42940 261 aa14.38□□□□□ -0.11
TAT1YBR069C RPN12P32496 274 aa14.37□□□□□ -0.11
TAT1YBR069C BDH2P39713 417 aa14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.5 ms