RNA–Protein interactions for RNA: YBL053W

YBL053W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL053W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL053W	YBL053W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	RRN7	P40992	514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	HST3	P53687	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YBL053W	YBL053W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YBL053W	YBL053W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YBL053W	YBL053W	TFB4	Q12004	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YBL053W	YBL053W	AFT1	P22149	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YBL053W	YBL053W	KIC1	P38692	1080 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YBL053W	YBL053W	CAF120	P53836	1060 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YBL053W	YBL053W	CSC1	Q06538	782 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YBL053W	YBL053W	MET32	Q12041	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YBL053W	YBL053W	TRK2	P28584	889 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YBL053W	YBL053W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YBL053W	YBL053W	YJR115W	P47152	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBL053W	YBL053W	YGR035C	P53222	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBL053W	YBL053W	YDR090C	Q03193	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBL053W	YBL053W	ACO2	P39533	789 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL053W	YBL053W	PUS5	Q06244	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBL053W	YBL053W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YBL053W	YBL053W	IFH1	P39520	1085 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBL053W	YBL053W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YBL053W	YBL053W	HPF1	Q05164	967 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL053W	YBL053W	OPT2	Q06593	877 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBL053W	YBL053W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YBL053W	YBL053W	MOD5	P07884	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	KEX2	P13134	814 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	ORC6	P38826	435 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	ICP55	P40051	511 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	SRF1	Q12516	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	YIR007W	P40566	764 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	ERF2	Q06551	359 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	UGA3	P26370	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
YBL053W	YBL053W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YBL053W	YBL053W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	SCW11	P53189	542 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	RGR1	P19263	1082 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	TUB4	P53378	473 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	MIP1	P15801	1254 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	AGE1	Q04412	482 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YBL053W	YBL053W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YBL053W	YBL053W	NUP85	P46673	744 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YBL053W	YBL053W	PHM7	Q12252	991 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YBL053W	YBL053W	KXD1	P53158	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YBL053W	YBL053W	MDJ1	P35191	511 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YBL053W	YBL053W	DPH6	Q12429	685 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YBL053W	YBL053W	COX6	P00427	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	KIP2	P28743	706 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	HXT10	P43581	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	NSG2	P53898	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	TPD3	P31383	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	LSC2	P53312	427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	ROG3	P43602	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	RTF1	P53064	558 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YBL053W	YBL053W	YNL115C	P53925	644 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	ARG82	P07250	355 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	IXR1	P33417	597 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	LYS5	P50113	272 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	THI72	Q08579	599 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	RTT106	P40161	455 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	DLD1	P32891	587 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	OSH7	P38755	437 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	AAD14	P42884	376 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YBL053W	YBL053W	CCP1	P00431	361 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YBL053W	YBL053W	CLB5	P30283	435 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YBL053W	YBL053W	JJJ3	P47138	172 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YBL053W	YBL053W	YJR098C	P47139	656 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YBL053W	YBL053W	YPR148C	Q06523	435 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YBL053W	YBL053W	AI1	P03875	834 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YBL053W	YBL053W	ALR1	Q08269	859 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YBL053W	YBL053W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YBL053W	YBL053W	VPS70	P47161	811 aa		4.42	□□□□□ -1.7

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