RNA–Protein interactions for RNA: YAL056C-A

YAL056C-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YAL056C-A, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAL056C-AYAL056C-A PTP3P40048 928 aa7.95□□□□□ -1.14
YAL056C-AYAL056C-A SRB8P25648 1427 aa7.92□□□□□ -1.14
YAL056C-AYAL056C-A BCK1Q01389 1478 aa7.92□□□□□ -1.14
YAL056C-AYAL056C-A MST1P07236 462 aa7.91□□□□□ -1.14
YAL056C-AYAL056C-A AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YAL056C-AYAL056C-A PDR11P40550 1411 aa7.91□□□□□ -1.14
YAL056C-AYAL056C-A SPT21P35209 758 aa7.89□□□□□ -1.15
YAL056C-AYAL056C-A KRE5P22023 1365 aa7.88□□□□□ -1.15
YAL056C-AYAL056C-A BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
YAL056C-AYAL056C-A ENT1Q12518 454 aa7.87□□□□□ -1.15
YAL056C-AYAL056C-A VNX1P42839 908 aa7.86□□□□□ -1.15
YAL056C-AYAL056C-A RIA1P53893 1110 aa7.85□□□□□ -1.15
YAL056C-AYAL056C-A ENV9Q08651 330 aa7.84□□□□□ -1.15
YAL056C-AYAL056C-A YRF1-2P40105 1681 aa7.83□□□□□ -1.16
YAL056C-AYAL056C-A FKH1P40466 484 aa7.81□□□□□ -1.16
YAL056C-AYAL056C-A BFR2Q06631 534 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
YAL056C-AYAL056C-A IMH1Q06704 911 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
YAL056C-AYAL056C-A CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
YAL056C-AYAL056C-A YNR029CP53729 429 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
YAL056C-AYAL056C-A RGA2Q06407 1009 aa7.79□□□□□ -1.16
YAL056C-AYAL056C-A YJL171CP46992 396 aa7.78□□□□□ -1.16
YAL056C-AYAL056C-A GCN2P15442 1659 aa7.78□□□□□ -1.16
YAL056C-AYAL056C-A MRX12P47084 519 aa7.77□□□□□ -1.17
YAL056C-AYAL056C-A RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
YAL056C-AYAL056C-A RRD1P40454 393 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
YAL056C-AYAL056C-A TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
YAL056C-AYAL056C-A SSA1P10591 642 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
YAL056C-AYAL056C-A NUP192P47054 1683 aa7.71□□□□□ -1.18
YAL056C-AYAL056C-A YBL086CP38177 466 aa7.71□□□□□ -1.18
YAL056C-AYAL056C-A SPP1Q03012 353 aa7.7□□□□□ -1.18
YAL056C-AYAL056C-A BCH2P36122 765 aa7.69□□□□□ -1.18
YAL056C-AYAL056C-A RPN11P43588 306 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
YAL056C-AYAL056C-A UBP1P25037 809 aa7.65□□□□□ -1.18
YAL056C-AYAL056C-A URB1P34241 1764 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
YAL056C-AYAL056C-A LEU3P08638 886 aa7.64□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A CAB1Q04430 367 aa7.64□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A YOR238WQ08634 303 aa7.64□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A PRP45P28004 379 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A TY4B-HP0C2J7 1802 aa7.62□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A TY4B-JP47024 1803 aa7.62□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A RAD9P14737 1309 aa7.61□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A LYS4P49367 693 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A FKS3Q04952 1785 aa7.61□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A UGA2P38067 497 aa7.6□□□□□ -1.19
YAL056C-AYAL056C-A DOT5P40553 215 aa7.58□□□□□ -1.2
YAL056C-AYAL056C-A NPR2P39923 615 aa7.57□□□□□ -1.2
YAL056C-AYAL056C-A SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
YAL056C-AYAL056C-A BMT6Q12291 365 aa7.56□□□□□ -1.2
YAL056C-AYAL056C-A TAF5P38129 798 aa7.55□□□□□ -1.2
YAL056C-AYAL056C-A TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YAL056C-AYAL056C-A CTH1P47976 325 aa7.53□□□□□ -1.2
YAL056C-AYAL056C-A FOX2Q02207 900 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YAL056C-AYAL056C-A GTT3P39996 337 aa7.52□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A ALD4P46367 519 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A ALD2P47771 506 aa7.52□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A PSK1P31374 1356 aa7.51□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A PRP5P21372 849 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.5□□□□□ -1.21not detected
YAL056C-AYAL056C-A MSB3P48566 633 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A IES2P40154 320 aa7.49□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A YJL181WP46987 611 aa7.49□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A WSC3Q12215 556 aa7.49□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A YRF1-3P0CX14 1859 aa7.49□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A YRF1-7P0CX15 1859 aa7.49□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A YRF1-6P53819 1859 aa7.49□□□□□ -1.21
YAL056C-AYAL056C-A RAV1P47104 1357 aa7.46□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A CPS1P27614 576 aa7.45□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A RCM1P53972 490 aa7.45□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A SSM4P40318 1319 aa7.44□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A ROM2P51862 1356 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A LDB19Q12502 818 aa7.42□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A EDE1P34216 1381 aa7.42□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A PPH3P32345 308 aa7.41□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A PRP40P33203 583 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A SNF2P22082 1703 aa7.41□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A COBP00163 385 aa7.4□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A LAM6Q08001 693 aa7.4□□□□□ -1.22
YAL056C-AYAL056C-A RSF2P46974 1380 aa7.39□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A TCB1Q12466 1186 aa7.39□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A BDF1P35817 686 aa7.38□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A YKR075CP36155 307 aa7.38□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A EAF6P47128 113 aa7.38□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A IOC2Q12072 812 aa7.38□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A YIL177CP40434 1758 aa7.38□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A YJL225CP40889 1758 aa7.38□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A YRF1-4O13559 1382 aa7.37□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A RTC1Q08281 1341 aa7.37□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A RIM101P33400 625 aa7.36□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A YKL133CP36066 463 aa7.36□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A PAF1P38351 445 aa7.36□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A TAF8Q03750 510 aa7.36□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A SSA4P22202 642 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YAL056C-AYAL056C-A ADE6P38972 1358 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YAL056C-AYAL056C-A YEF3P16521 1044 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YAL056C-AYAL056C-A EPS1P40557 701 aa7.33□□□□□ -1.24
YAL056C-AYAL056C-A SLM3Q12093 417 aa7.33□□□□□ -1.24
YAL056C-AYAL056C-A APC1P53886 1748 aa7.31□□□□□ -1.24
YAL056C-AYAL056C-A NAP1P25293 417 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YAL056C-AYAL056C-A RIM15P43565 1770 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.9 ms