RNA–Protein interactions for RNA: YAL032C

PRP45, Transcript of Protein required for pre-mRNA splicing, yeastyeast

Gene PRP45, Length 1,140 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45YAL032C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PRP45YAL032C YOR093CQ12275 1648 aa7.67□□□□□ -1.18
PRP45YAL032C SRB8P25648 1427 aa7.67□□□□□ -1.18
PRP45YAL032C SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PRP45YAL032C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PRP45YAL032C WSC3Q12215 556 aa7.62□□□□□ -1.19
PRP45YAL032C YFR006WP43590 535 aa7.61□□□□□ -1.19
PRP45YAL032C DNF3Q12674 1656 aa7.6□□□□□ -1.19
PRP45YAL032C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PRP45YAL032C RTG3P38165 486 aa7.59□□□□□ -1.19
PRP45YAL032C RCR1P38212 213 aa7.58□□□□□ -1.2
PRP45YAL032C YAP3P38749 330 aa7.58□□□□□ -1.2
PRP45YAL032C GTT3P39996 337 aa7.58□□□□□ -1.2
PRP45YAL032C VPS29P38759 282 aa7.57□□□□□ -1.2
PRP45YAL032C SSM4P40318 1319 aa7.56□□□□□ -1.2
PRP45YAL032C VNX1P42839 908 aa7.56□□□□□ -1.2
PRP45YAL032C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.54□□□□□ -1.2not detected
PRP45YAL032C URN1Q06525 465 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PRP45YAL032C DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PRP45YAL032C SPP1Q03012 353 aa7.53□□□□□ -1.2
PRP45YAL032C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PRP45YAL032C VMR1P38735 1592 aa7.5□□□□□ -1.21
PRP45YAL032C STS1P38637 319 aa7.5□□□□□ -1.21
PRP45YAL032C MAK10Q02197 733 aa7.49□□□□□ -1.21
PRP45YAL032C TYS1P36421 394 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PRP45YAL032C IPL1P38991 367 aa7.48□□□□□ -1.21
PRP45YAL032C IML1P47170 1584 aa7.47□□□□□ -1.21
PRP45YAL032C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PRP45YAL032C GCN2P15442 1659 aa7.44□□□□□ -1.22
PRP45YAL032C USO1P25386 1790 aa7.44□□□□□ -1.22
PRP45YAL032C TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PRP45YAL032C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PRP45YAL032C SET4P42948 560 aa7.41□□□□□ -1.22
PRP45YAL032C PDR11P40550 1411 aa7.39□□□□□ -1.23
PRP45YAL032C ULI1P43604 169 aa7.39□□□□□ -1.23
PRP45YAL032C YOL036WQ08206 761 aa7.38□□□□□ -1.23
PRP45YAL032C HAP1P0CE41 1502 aa7.37□□□□□ -1.23
PRP45YAL032C PAF1P38351 445 aa7.36□□□□□ -1.23
PRP45YAL032C RAM2P29703 316 aa7.35□□□□□ -1.23
PRP45YAL032C LDB19Q12502 818 aa7.35□□□□□ -1.23
PRP45YAL032C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C THI12P42883 340 aa7.33□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C THI5P43534 340 aa7.33□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C THI11P47183 340 aa7.33□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C THI13Q07748 340 aa7.33□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C IOC2Q12072 812 aa7.33□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C MSB4Q12317 492 aa7.33□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C NOP7P53261 605 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C KRE5P22023 1365 aa7.32□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C SAM3Q08986 587 aa7.31□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C RAV1P47104 1357 aa7.31□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C MRX12P47084 519 aa7.3□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C RIA1P53893 1110 aa7.3□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C YMR196WQ04336 1088 aa7.3□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C FKH1P40466 484 aa7.28□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRP45YAL032C MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C GYP5Q12344 894 aa7.27□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C RAD9P14737 1309 aa7.26□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C RTC1Q08281 1341 aa7.26□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C NUP192P47054 1683 aa7.25□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C BCK1Q01389 1478 aa7.25□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C DCW1P36091 449 aa7.25□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C CAB1Q04430 367 aa7.25□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C RTG1P32607 177 aa7.24□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C LEO1P38439 464 aa7.24□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C YJL171CP46992 396 aa7.24□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C EDS1P38073 919 aa7.22□□□□□ -1.25
PRP45YAL032C TAF5P38129 798 aa7.21□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C ALD4P46367 519 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C COQ8P27697 501 aa7.2□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C HTA2P04912 132 aa7.18□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C LEU3P08638 886 aa7.17□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C NCR1Q12200 1170 aa7.17□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C NAP1P25293 417 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C ESL2P36168 1195 aa7.16□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C TAF8Q03750 510 aa7.16□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C ATH1P48016 1211 aa7.15□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C BMT6Q12291 365 aa7.15□□□□□ -1.26
PRP45YAL032C YEL023CP39992 682 aa7.14□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C SEC61P32915 480 aa7.13□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C DAN4P47179 1161 aa7.13□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C RCM1P53972 490 aa7.11□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C JIP4Q03361 876 aa7.11□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C GUT1P32190 709 aa7.1□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C PTC4P38089 393 aa7.1□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C KIP3P53086 805 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C APP1P53933 587 aa7.1□□□□□ -1.27
PRP45YAL032C SPE2P21182 396 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.9 ms