RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613358.4

PGRMC2-208, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 3,783 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-208ENST00000613358 FBLN2P98095 1184 aa23.51■■□□□ 1.35
PGRMC2-208ENST00000613358 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.51■■□□□ 1.35
PGRMC2-208ENST00000613358 MAP3K1Q13233 1512 aa23.51■■□□□ 1.35
PGRMC2-208ENST00000613358 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.353e-7■■■■□ 26.1
PGRMC2-208ENST00000613358 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.49■■□□□ 1.35
PGRMC2-208ENST00000613358 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PGRMC2-208ENST00000613358 FMN1Q68DA7 1419 aa23.47■■□□□ 1.35
PGRMC2-208ENST00000613358 PTPRKQ15262 1439 aa23.47■■□□□ 1.35
PGRMC2-208ENST00000613358 NCOA2Q15596 1464 aa23.46■■□□□ 1.35
PGRMC2-208ENST00000613358 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.45■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 HFM1A2PYH4 1435 aa23.45■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.44■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.44■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 NCOA1Q15788 1441 aa23.43■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 ARID3CA6NKF2 412 aa23.43■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.43■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.41■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 NAIPQ13075 1403 aa23.41■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PGRMC2-208ENST00000613358 PLIN1O60240 522 aa23.39■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 TOPBP1Q92547 1522 aa23.39■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 MS4A1P11836 297 aa23.39■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.39■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 ARXQ96QS3 562 aa23.38■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.337e-10■□□□□ 8.6
PGRMC2-208ENST00000613358 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.34■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.34■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.34■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 ERCC6Q03468 1493 aa23.34■■□□□ 1.33
PGRMC2-208ENST00000613358 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.27■■□□□ 1.32
PGRMC2-208ENST00000613358 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PGRMC2-208ENST00000613358 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.26■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 CRBNQ96SW2 442 aa23.26■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.25■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.25■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.24■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.24■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 RGS3P49796 1198 aa23.23■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.23■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.23■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.22■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.2■■□□□ 1.31
PGRMC2-208ENST00000613358 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PGRMC2-208ENST00000613358 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.19■■□□□ 1.3
PGRMC2-208ENST00000613358 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PGRMC2-208ENST00000613358 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.15■■□□□ 1.3
PGRMC2-208ENST00000613358 USP47Q96K76 1375 aa23.14■■□□□ 1.3
PGRMC2-208ENST00000613358 POGKQ9P215 609 aa23.11■■□□□ 1.29
PGRMC2-208ENST00000613358 FAM161AQ3B820 660 aa23.1■■□□□ 1.29
PGRMC2-208ENST00000613358 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PGRMC2-208ENST00000613358 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.09■■□□□ 1.29
PGRMC2-208ENST00000613358 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PGRMC2-208ENST00000613358 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.08■■□□□ 1.29
PGRMC2-208ENST00000613358 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.08■■□□□ 1.29
PGRMC2-208ENST00000613358 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 PRDM2Q13029 1718 aa23.06■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.05■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 PDE3BQ13370 1112 aa23.05■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 KIF15Q9NS87 1388 aa23.05■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 ZMYND15Q9H091 742 aa23.03■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.03■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 RALBP1Q15311 655 aa23.02■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.02■■□□□ 1.28
PGRMC2-208ENST00000613358 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.99■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 NLRP13Q86W25 1043 aa22.99■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 C8orf34Q49A92 452 aa22.98■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 KDM6BO15054 1643 aa22.96■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 MIA2Q96PC5 1412 aa22.95■■□□□ 1.27
PGRMC2-208ENST00000613358 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PGRMC2-208ENST00000613358 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.93■■□□□ 1.26
PGRMC2-208ENST00000613358 BECN1Q14457 450 aa22.93■■□□□ 1.26
PGRMC2-208ENST00000613358 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.92■■□□□ 1.26
PGRMC2-208ENST00000613358 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.92■■□□□ 1.26
PGRMC2-208ENST00000613358 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.91■■□□□ 1.26
PGRMC2-208ENST00000613358 HECW1Q76N89 1606 aa22.9■■□□□ 1.26
PGRMC2-208ENST00000613358 PKD2Q13563 968 aa22.9■■□□□ 1.26
PGRMC2-208ENST00000613358 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.87■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.87■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PGRMC2-208ENST00000613358 GRIN2BQ13224 1484 aa22.86■■□□□ 1.25
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