RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	CKA1	P15790	372 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	SEC62	P21825	274 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	MRE11	P32829	692 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	RIM2	P38127	377 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YER130C	P39959	443 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YJL068C	P40363	299 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	GUF1	P46943	645 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	RIM20	Q12033	661 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	ELO2	P25358	347 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	VID24	P38263	362 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YTA12	P40341	825 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YJR154W	P47181	346 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	TWF1	P53250	332 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	THI20	Q08224	551 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	NRT1	Q08485	598 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	CDC23	P16522	626 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	PPZ1	P26570	692 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	GPI10	P30777	616 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	ECM15	P35195	104 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	CMC1	P36064	111 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	BNA4	P38169	460 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	MET18	P40469	1032 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	AIM22	P47051	409 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	SRB7	P47822	140 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	PDS5	Q04264	1277 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	RBA50	Q04418	439 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	ATG29	Q12092	213 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	SEC39	Q12745	709 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YML133C	Q03099	1374 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	COR1	P07256	457 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	APE1	P14904	514 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	MUM2	P38236	366 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	CSM2	P40465	213 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	TAF11	Q04226	346 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YLR287C	Q05881	355 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	RED1	P14291	827 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	ROX1	P25042	368 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	PMT1	P33775	817 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	RTT107	P38850	1070 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	MBB1	P39534	108 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	IKS1	P47042	667 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	JJJ1	P53863	590 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	RAV1	P47104	1357 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	MSN2	P33748	704 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	DUG2	P38149	878 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	SMF1	P38925	575 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YJL070C	P40361	888 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	HXT14	P42833	540 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
YNL171C	YNL171C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	IVY1	Q04934	453 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	GRX6	Q12438	231 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL171C	YNL171C	SUC2	P00724	532 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	UTR4	P32626	227 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	VPS52	P39904	641 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	SLD5	Q03406	294 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	PHO92	Q06390	306 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	DAP1	Q12091	152 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	TIP41	Q12199	356 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	RTN2	Q12443	393 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	PMS1	P14242	873 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	YCR007C	P25354	239 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	SEC66	P33754	206 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	GPI1	P53306	609 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	CRZ1	P53968	678 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	SYO1	Q07395	620 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	EXO70	P19658	623 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	ERG3	P32353	365 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	FRE1	P32791	686 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL171C	YNL171C	PTR2	P32901	601 aa		3.94	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.8 ms