RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL063CYKL063C AFG3P39925 761 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C GWT1P47026 490 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C YJR154WP47181 346 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C SUC2P00724 532 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C YME1P32795 747 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C MRP4P32902 394 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C YBR144CP34215 104 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C PTH2P34222 208 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C APT1P49435 187 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C ELP3Q02908 557 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C PIR3Q03180 325 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C YML037CQ03703 340 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C MRPL35Q06678 367 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C NBP2Q12163 236 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C YCR007CP25354 239 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C YHR210CP38893 341 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C LYS14P40971 790 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YKL063CYKL063C SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C MES1P00958 751 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C EST1P17214 699 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ELO2P25358 347 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C HXT1P32465 570 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C UTR4P32626 227 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C YBL059WP34224 193 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C FAR3P46671 204 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C YGR127WP53275 312 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C IPI3P53877 555 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C APJ1P53940 528 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ARK1P53974 638 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C PBA1Q05778 276 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C MHR1Q06630 226 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C THP1Q08231 455 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ERV2Q12284 196 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C CDC24P11433 854 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C YCK1P23291 538 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C MSN2P33748 704 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C TIF4631P39935 952 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C FAU1P40099 211 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C GCD10P41814 478 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C AVT4P50944 713 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C BSC5P53755 489 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C HRT3Q12347 344 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C SKM1Q12469 655 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C YIH1P25637 258 aa2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C RRN3P36070 627 aa2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C CIN4P39110 191 aa2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ARC1P46672 376 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C AIM22P47051 409 aa2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C NGL3Q03210 505 aa2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ATG16Q03818 150 aa2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C VPS74Q06385 345 aa2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C THP3Q12049 470 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C HIP1P06775 603 aa2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ART10P18634 518 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C DUG2P38149 878 aa2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C BNA4P38169 460 aa2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C YFL067WP43537 175 aa2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C GPI1P53306 609 aa2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C GOR1P53839 350 aa2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C YML131WQ03102 365 aa2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C HEL2Q05580 639 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C RBD2Q12270 262 aa2.43□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C HEM15P16622 393 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C SUI2P20459 304 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C PRE8P23639 250 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C CPR4P25334 318 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C FRE2P36033 711 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C SRO77P38163 1010 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C TPM2P40414 161 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.42□□□□□ -2.02not detected
YKL063CYKL063C ELP2P42935 788 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C RRT5P43607 289 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C SDT1P53078 280 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ART5P53244 586 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C ZPR1P53303 486 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C YLR152CP54072 576 aa2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
YKL063CYKL063C SSP2Q08646 371 aa2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.7 ms