RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W STF1P01098 86 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W CHO1P08456 276 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YML002WP0CF17 737 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YMR085WP0CF18 432 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SUI2P20459 304 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W IMD2P38697 523 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W ERV46P39727 415 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W CFD1P40558 293 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W CDC1P40986 491 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W VMA13P41807 478 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SAE2P46946 345 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W URB2P47108 1174 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W ORC5P50874 479 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YTP1P53584 459 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W RSM23Q01163 450 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W TOF2Q02208 771 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W TPO3Q06451 622 aa3.46□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.86not detected
SNX4YJL036W HIP1P06775 603 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W GPA1P08539 472 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SPS4P09937 338 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W KRS1P15180 591 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W URA4P20051 364 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W IDH2P28241 369 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W MSP1P28737 362 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SMI1P32566 505 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W ARA1P38115 344 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YIL024CP40543 189 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W FMS1P50264 508 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YGR126WP53274 230 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W DUG3P53871 357 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W MSC1Q03104 513 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YMR160WQ03823 816 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W MMR1Q06324 491 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YDL057WQ07379 328 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W MCH4Q08268 501 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W HER1Q12276 1246 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W RAV1P47104 1357 aa3.45□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W COR1P07256 457 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W PUT2P07275 575 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W CLB2P24869 491 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SNT1P25357 1226 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W RAD14P28519 371 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YIM1P28625 365 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W BRF1P29056 596 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W AFG1P32317 509 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W HEL1P36113 551 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YJL107CP42947 387 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W IRC7P43623 340 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W AIM22P47051 409 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W COS5P47187 383 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SKO1Q02100 647 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YMR130WQ04223 302 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W PDR8Q06149 701 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YLR456WQ06199 204 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W COS7Q07788 383 aa3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W LPD1P09624 499 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YER190C-BP0CX94 160 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YEL077W-AP0CX95 160 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YGR296C-BP0CX96 160 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YPL283W-BP0CX97 160 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YPR204C-AP0CX98 160 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W CLN1P20437 546 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W PHO84P25297 587 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W ELO2P25358 347 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W OCT1P35999 772 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W MIA40P36046 403 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W PIM1P36775 1133 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W MMS4P38257 691 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W WSS1P38838 269 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W PES4P39684 611 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W CIN1P40987 1014 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W ATG27P46989 271 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W YGL108CP53139 140 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W ACL4Q03771 387 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W TAP42Q04372 366 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W ATG26Q06321 1198 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W THP1Q08231 455 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SKS1Q12505 502 aa3.43□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W DAL5P15365 543 aa3.42□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W SPO7P18410 259 aa3.42□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNX4YJL036W MAK32P23060 363 aa3.42□□□□□ -1.86
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