RNA–Protein interactions for RNA: YHR195W

NVJ1, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene NVJ1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NVJ1	YHR195W	YIL060W	P40519	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SNO3	P43544	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	STB2	P46679	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	AIM32	Q04689	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	EDE1	P34216	1381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVJ1	YHR195W	SNF3	P10870	884 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	CNA1	P23287	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ELO2	P25358	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	BUD14	P27637	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	SEC66	P33754	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	VRG4	P40107	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	AIM22	P47051	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YGR126W	P53274	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	DUG3	P53871	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	EOS1	P53938	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	RRN5	Q02983	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	CLB1	P24868	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YCR051W	P25631	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	GAC1	P28006	793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PUP2	P32379	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	SMI1	P32566	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	TFB1	P32776	642 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	MIC60	P36112	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	UIP5	P36137	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	HSM3	P38348	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	HXT9	P40885	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
NVJ1	YHR195W	YJL055W	P47044	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	NUP84	P52891	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ALF1	P53904	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ARV1	Q06541	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	MCP2	Q06567	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PET123	P17558	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	RPB8	P20436	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	SWH1	P35845	1188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	UBA4	P38820	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ZIM17	P42844	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	VPS25	P47142	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PKP2	P53170	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	TOF2	Q02208	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	AFI1	Q99222	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ISN1	Q99312	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	APE1	P14904	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	OM45	P16547	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	GRR1	P24814	1151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PIM1	P36775	1133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ROT2	P38138	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YIL024C	P40543	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	GCD10	P41814	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	AGX1	P43567	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	SNG1	P46950	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YPT11	P48559	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ARP10	Q04549	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ROY1	Q04847	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	RDR1	Q08904	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	CRC1	Q12289	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	MRPL25	P23369	157 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PPH22	P23595	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PEX18	P38855	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	FLO5	P38894	1075 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	ARP5	P53946	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	RIM13	Q03792	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	CAC2	Q04199	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	MGR3	Q04472	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	VTA1	Q06263	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	NFI1	Q12216	726 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	COR1	P07256	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NVJ1	YHR195W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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