RNA–Protein interactions for RNA: YHR134W

WSS1, Transcript of Metalloprotease involved in DNA repair, removes DNA-protein crosslinks at stalled replication forks during replication of damaged DNA, yeast

Gene WSS1, Length 810 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSS1	YHR134W	LAM5	P43560	674 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	JJJ1	P53863	590 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	RDR1	Q08904	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	SPE4	Q12455	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YIH1	P25637	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	DAL80	P26343	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	MRE11	P32829	692 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	BYE1	P36106	594 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	RIM2	P38127	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YBL029W	P38201	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YER130C	P39959	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	TEN1	Q07921	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	NFI1	Q12216	726 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	REV3	P14284	1504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	STF1	P01098	86 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	PMS1	P14242	873 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	GLN3	P18494	730 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	TYR1	P20049	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YCK1	P23291	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	BOS1	P25385	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	HIR2	P32480	875 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	MAF1	P41910	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	RSM23	Q01163	450 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	MSC1	Q03104	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	MSS11	Q03825	758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ARR1	Q06596	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	SSK1	Q07084	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YEH2	Q07950	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	PGC1	Q08959	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	KSS1	P14681	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	NTG1	P31378	399 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	TRS65	P32893	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YBL028C	P38202	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	HSM3	P38348	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	CCT6	P39079	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	RHO4	Q00246	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	THI20	Q08224	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	SDH5	Q08230	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ENT1	Q12518	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	SIN3	P22579	1536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	PHO2	P07269	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ACH1	P32316	526 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	IMP2'	P32351	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YBR144C	P34215	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ROT2	P38138	954 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YEL068C	P39977	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	TMA108	P40462	946 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	LYS14	P40971	790 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	AZF1	P41696	914 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	HST1	P53685	503 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YML037C	Q03703	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ERV41	Q04651	352 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YEH1	Q07804	573 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	SSK2	P53599	1579 aa		4.53	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	IMG1	P25626	169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	YHR131C	P38835	850 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	CIN4	P39110	191 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	JEM1	P40358	645 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	ESL1	P40456	1118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	AXL1	P40851	1208 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	GCD10	P41814	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	PTR3	P43606	678 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	RAD17	P48581	401 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	ALT2	P52892	507 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	YGL260W	P53056	76 aa		4.52	□□□□□ -1.69
WSS1	YHR134W	YNL050C	P53952	270 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 97.1 ms