RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RDI1	Q12434	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	APM4	Q99186	491 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	GCR1	P07261	785 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PEX1	P24004	1043 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SRB5	P32585	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SRP101	P32916	621 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
DNF2	YDR093W	YKL075C	P36083	450 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SSN3	P39073	555 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ERP2	P39704	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MET12	P46151	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SSY1	Q03770	852 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	HER1	Q12276	1246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TYR1	P20049	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MRPS28	P21771	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	GID7	P25569	745 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	UBC8	P28263	218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SFC1	P33303	322 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PMT1	P33775	817 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NAS2	P40555	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CIN2	P46670	268 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PUN1	Q06991	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SNF8	Q12483	233 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MDM12	Q92328	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YME2	P32843	850 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YHR122W	P38829	231 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NUP85	P46673	744 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PAC10	P48363	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	HRD3	Q05787	833 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CDC123	Q05791	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YET3	Q07451	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	VCX1	Q99385	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	FLO11	P08640	1367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	BET2	P20133	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PTP1	P25044	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NUD1	P32336	851 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MDM31	P38880	579 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YHR218W	P38899	603 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MEP1	P40260	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	COX16	P47081	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PRM1	P53835	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TEP1	P53916	434 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ATG21	Q02887	496 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TRM82	Q03774	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RAD34	Q06665	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TCO89	Q08921	799 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CCP1	P00431	361 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	KIN3	P22209	435 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CYC2	P38909	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YAR028W	P39548	234 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	DAN4	P47179	1161 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	AIM14	P53109	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	VPS74	Q06385	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SIR3	P06701	978 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ARG1	P22768	420 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ATO2	P32907	282 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	BMT2	P38278	337 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	STS1	P38637	319 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YAP1801	P38856	637 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YJR115W	P47152	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	VOA1	P53262	265 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ZRG17	P53735	605 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NRK1	P53915	240 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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