RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W TPA1P40032 644 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W IRC5P43610 853 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YJR154WP47181 346 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SCY1P53009 804 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W UFD1P53044 361 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TUB4P53378 473 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MEP3P53390 489 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RRN9P53437 365 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PNP1Q05788 311 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TFC6Q06339 672 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RFU1Q08003 200 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W REX4Q08237 289 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GUP2Q08929 609 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FLC1Q08967 793 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GET3Q12154 354 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RAD59Q12223 238 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FUM1P08417 488 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W LHP1P33399 275 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RPF2P36160 344 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PPS1P38148 807 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SLM4P38247 162 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SPC97P38863 823 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MSS2P40990 351 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YPT32P51996 222 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YGR026WP53217 278 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W EEB1Q02891 456 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W OST6Q03723 332 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W THI22Q06490 572 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W COS7Q07788 383 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data5.07□□□□□ -1.6not detected
CYK3YDL117W MDY2Q12285 212 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W DNF3Q12674 1656 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PDR11P40550 1411 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RAD7P06779 565 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MRP1P10662 321 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ATR1P13090 542 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RGR1P19263 1082 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W VPS33P20795 691 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PPH22P23595 377 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FPS1P23900 669 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YIM1P28625 365 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GLY1P37303 387 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SLI15P38283 698 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YHR045WP38775 560 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GIC1P38785 314 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GIP4P39732 760 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NPR2P39923 615 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TGL3P40308 642 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W QDR1P40475 563 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W EFM4P40516 257 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W DOT5P40553 215 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ALR2P43553 858 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YGL204CP53089 101 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GUP1P53154 560 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SHY1P53266 389 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YNL115CP53925 644 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YDC1Q02896 317 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PEX10Q05568 337 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PCD1Q12524 340 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W Q0144Q9ZZW2 109 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PHO4P07270 312 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MRP7P12687 371 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FUR1P18562 216 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ERG1P32476 496 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NDC1P32500 655 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FRD1P32614 470 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SIP2P34164 415 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W KAE1P36132 386 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SIF2P38262 535 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W OSW5P40219 148 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W IDP2P41939 412 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NET1P47035 1189 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MRX6P48564 524 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TYW3P53177 273 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ART5P53244 586 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YNR062CP53748 327 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PEX13P80667 386 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YDR248CQ03786 193 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W THI73Q07904 523 aa5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GAL4P04386 881 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GAL10P04397 699 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PET54P10834 293 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GAL2P13181 574 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W URA6P15700 204 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HOP1P20050 605 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MGR1P25573 417 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W LIP5P32875 414 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YKL077WP36081 392 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GPT2P36148 743 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YHL041WP38730 149 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W BZZ1P38822 633 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.6 ms