RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	MRP13	P12686	339 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	CLB2	P24869	491 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SNT1	P25357	1226 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	MIA40	P36046	403 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SCO2	P38072	301 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	MSR1	P38714	643 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YAT2	P40017	923 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	LCB2	P40970	561 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	ZIM17	P42844	174 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	FMS1	P50264	508 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	BTN2	P53286	410 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YNL144C	P53907	740 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	HOT1	Q03213	719 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	PDS5	Q04264	1277 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SWF1	Q04629	336 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	TEN1	Q07921	160 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	MED2	Q12124	431 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SKS1	Q12505	502 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	ISN1	Q99312	450 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	GAC1	P28006	793 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RML2	P32611	393 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YND1	P40009	630 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	UBP8	P50102	471 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	EOS1	P53938	366 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SKO1	Q02100	647 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	PFA5	Q03289	374 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	GYL1	Q04322	720 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	POS5	Q06892	414 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	FMP45	Q07651	309 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	PGC1	Q08959	321 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	HIF1	Q12373	385 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	PUT2	P07275	575 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SPS4	P09937	338 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YME2	P32843	850 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	TUL1	P36096	758 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RRT2	P38332	387 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	CUL3	P53202	744 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YGR111W	P53265	400 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	BET4	Q00618	327 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	TOF2	Q02208	771 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	ECI1	Q05871	280 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	ECM30	Q06673	1274 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	GRS2	Q06817	618 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	CTF3	Q12748	733 aa		3	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RHO2	P06781	192 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	CBP1	P07252	654 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	CHO1	P08456	276 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	CDC23	P16522	626 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YCR006C	P25350	157 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	ERV1	P27882	189 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SLM4	P38247	162 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YIL169C	P40442	995 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	COS5	P47187	383 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YGR149W	P48236	432 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YGL138C	P53122	345 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	YGR126W	P53274	230 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	ASI1	P54074	624 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RSM23	Q01163	450 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	MSC1	Q03104	513 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	TAP42	Q04372	366 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RSF1	Q05043	376 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	ATG26	Q06321	1198 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	COS7	Q07788	383 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	NRT1	Q08485	598 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	GPM3	Q12326	303 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	HSP42	Q12329	375 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	HIP1	P06775	603 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AIM4	YBR194W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93

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