RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W SWC7Q06707 132 aa10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NBP2Q12163 236 aa10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MHF2Q3E829 80 aa10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W COX5AP00424 153 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ENA1P13587 1091 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RSR1P13856 272 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W VPS33P20795 691 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W HSP30P25619 332 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W PTC6P25646 442 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W HIR2P32480 875 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W VPS21P36017 210 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W KTR4P38131 464 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W FUI1P38196 639 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W FHL1P39521 936 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W BOL3P39724 118 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ELO3P40319 345 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W HOC1P47124 396 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SAP4P53036 818 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W FPK1P53739 893 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ARP4P80428 489 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W CDC14Q00684 551 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ENA2Q01896 1091 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W TAF12Q03761 539 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SPO20Q04359 397 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W TRE2Q08693 809 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W GPB1Q08886 897 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W DDC1Q08949 612 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W NUS1Q12063 375 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ENA5Q12691 1091 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YPL119C-AQ3E751 87 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W HIS1P00498 297 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ADE4P04046 510 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W GIT1P25346 518 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W TIM23P32897 222 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data10.14□□□□□ -0.79not detected
PRP4YPR178W YAR028WP39548 234 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MTW1P39731 289 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YEL020CP39994 560 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YIR007WP40566 764 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W PAC11P40960 533 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SPC105P53148 917 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W NEJ1Q06148 342 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MAM3Q12296 706 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W JLP1Q12358 412 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa10.14□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W HTA2P04912 132 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SEC53P07283 254 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MAS2P11914 482 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YIH1P25637 258 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W CDC5P32562 705 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RIB1P38066 345 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W FLR1P38124 548 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ARN2P38724 620 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W EDC3P39998 551 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W DDI1P40087 428 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ESL1P40456 1118 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W FKH2P41813 862 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MSC2Q03455 724 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YML020WQ03722 664 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MRX10Q05648 414 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RIF2Q06208 395 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SYO1Q07395 620 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ARP7Q12406 477 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RMD5Q12508 421 aa10.13□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W GPM1P00950 247 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ARG81P05085 880 aa10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YAP1P19880 650 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W CYS3P31373 394 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W UTP30P36144 274 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W SLI15P38283 698 aa10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W STB5P38699 743 aa10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RIM4P38741 713 aa10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W AYR1P40471 297 aa10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W COP1P53622 1201 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W EFM6P53970 246 aa10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RSC4Q02206 625 aa10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MDM12Q92328 271 aa10.12□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W CCP1P00431 361 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W ATP1P07251 545 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W YCL049CP25577 312 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RAD27P26793 382 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W MSS51P32335 436 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W STB6P36085 766 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RAD55P38953 406 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W RSP5P39940 809 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W CDC1P40986 491 aa10.11□□□□□ -0.79
PRP4YPR178W GYP8P43570 497 aa10.11□□□□□ -0.79
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