RNA–Protein interactions for RNA: YHR170W

NMD3, Transcript of Protein involved in nuclear export of the large ribosomal subunit, yeast

Gene NMD3, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD3	YHR170W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	COQ6	P53318	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	MRS2	Q01926	470 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	FAR8	Q05040	523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	SWC7	Q06707	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	PSR1	Q07800	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	NRT1	Q08485	598 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	LDB17	Q12342	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	NCA2	Q12374	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	AHC1	Q12433	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	UBR1	P19812	1950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	COX5A	P00424	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	MIH1	P23748	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	ECM13	P38195	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	CTF8	P38877	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	EMP65	P40085	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	SDP1	P40479	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	GND2	P53319	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YPR003C	P53394	754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	BIO4	P53630	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	REG1	Q00816	1014 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	BLS1	Q06071	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	ATG33	Q06485	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	SLD7	Q08457	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	OCA6	Q12454	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	AFI1	Q99222	893 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YCL068C	P25593	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	GDA1	P32621	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YBR032W	P38223	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	SFB3	P38810	929 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	NUP60	P39705	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	RAD26	P40352	1085 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	UFE1	P41834	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	RTT101	P47050	842 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	PCL10	P53124	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	ECM9	Q02202	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	INP2	Q03824	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	BSP1	Q06604	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	AAD15	Q08361	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	CCH1	P50077	2039 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	HMG1	P12683	1054 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	BRF1	P29056	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	URA10	P30402	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	MEP1	P40260	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	PXA1	P41909	870 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	TDA10	P42938	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YJL132W	P47014	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	GPI8	P49018	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YGR016W	P53209	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	PEX15	Q08215	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	GUP2	Q08929	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
NMD3	YHR170W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	SED4	P25365	1065 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	AAD3	P25612	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	DEP1	P31385	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	NDI1	P32340	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	HOG1	P32485	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	STB5	P38699	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YJL206C	P39529	758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	MRX1	P40050	688 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	BST1	P43571	1029 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	AMA1	P50082	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	CIA1	Q05583	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	GRX8	Q05926	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	VHS3	Q08438	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NMD3	YHR170W	NPC2	Q12408	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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