RNA–Protein interactions for RNA: YHR147C

MRPL6, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL6, Length 645 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL6	YHR147C	YGR126W	P53274	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	VPS75	P53853	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	SHR3	Q02774	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	SDH5	Q08230	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	BSC1	Q12140	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	SGS1	P35187	1447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	BAR1	P12630	587 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	PEP5	P12868	1029 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	RPN12	P32496	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	SNG1	P46950	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	MSC1	Q03104	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	COG4	Q06096	861 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	AVL9	Q12500	764 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	MRP7	P12687	371 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	MET8	P15807	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	SPC34	P36131	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	MSS11	Q03825	758 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	GLO2	Q05584	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	YEH2	Q07950	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	NRT1	Q08485	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	GAL80	P04387	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
MRPL6	YHR147C	GLN3	P18494	730 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	OCA4	P25366	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	VPS17	P32913	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	GCS1	P35197	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	RTT107	P38850	1070 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	NPR2	P39923	615 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	YJL068C	P40363	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
MRPL6	YHR147C	SCS3	P53012	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	SAM50	P53969	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	MFB1	Q04922	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	DIC1	Q06143	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	FMP45	Q07651	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	FOB1	O13329	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	CDC23	P16522	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	TYR1	P20049	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	PPZ1	P26570	692 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	ACH1	P32316	526 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	YME1	P32795	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	RIM2	P38127	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	MSR1	P38714	643 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	YAT2	P40017	923 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	DOT5	P40553	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
MRPL6	YHR147C	MEP2	P41948	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	RHO4	Q00246	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	TOF2	Q02208	771 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	FIN1	Q03898	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	RLM1	Q12224	676 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	SRO77	P38163	1010 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	ERP2	P39704	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	STB2	P46679	850 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	GUF1	P46943	645 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	RTP1	Q12751	981 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL6	YHR147C	SEC62	P21825	274 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	SHP1	P34223	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	YHR210C	P38893	341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	YER130C	P39959	443 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	NDE1	P40215	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	YTA12	P40341	825 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	SPO22	P40511	975 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	ALT2	P52892	507 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	BUD32	P53323	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	THI20	Q08224	551 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	NDD1	Q08887	554 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
MRPL6	YHR147C	INH1	P01097	85 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	ARG3	P05150	338 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	YJL070C	P40361	888 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	MET28	P40573	187 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	TIM10	P87108	93 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	COQ9	Q05779	260 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	THP1	Q08231	455 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	PRD1	P25375	712 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	YUR1	P26725	428 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MRPL6	YHR147C	ECM15	P35195	104 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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