RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	GTR2	P53290	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PUS6	P53294	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	TEP1	P53916	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	TRM12	Q04235	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NTG2	Q08214	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	AKR2	Q12013	749 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RPN13	O13563	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PET54	P10834	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	COQ1	P18900	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SYN8	P31377	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GEX2	P36173	615 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MMS4	P38257	691 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NUT2	Q06213	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	OCA6	Q12454	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RMP1	Q12530	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ADR1	P07248	1323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	AI4	P03878	556 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MSF1	P08425	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MNE1	P24720	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PEX3	P28795	441 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GUT2	P32191	649 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	AME1	P38313	324 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RGD1	P38339	666 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	BUR6	P40096	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MPS3	P47069	682 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ACL4	Q03771	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	AFT2	Q08957	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	UPC2	Q12151	913 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NCR1	Q12200	1170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ATE1	P16639	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SFB3	P38810	929 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PSF2	P40359	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	POG1	P40473	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ASI3	P53983	676 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	INP53	Q12271	1107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RAD14	P28519	371 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PRR1	P28708	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YHR182W	P38870	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GID8	P40208	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SCY1	P53009	804 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MEP3	P53390	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	TIM44	Q01852	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	WHI5	Q12416	295 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PHO3	P24031	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ATG15	P25641	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	MRP49	P32388	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YKL075C	P36083	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ZRG17	P53735	605 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	HOF1	Q05080	669 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SIF2	P38262	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NEM1	P38757	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	VAC8	P39968	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RTT101	P47050	842 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YGR153W	P48238	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	TRM9	P49957	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	LCL3	P53153	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	SLI1	P53304	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	ATG31	Q12421	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	FRT1	Q99332	602 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	DOA1	P36037	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	EDS1	P38073	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NAS2	P40555	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	AAD10	P47182	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	PPT1	P53043	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	BOR1	P53838	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	CAB1	Q04430	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RSF1	Q05043	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	RRG8	Q06109	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BLM10	YFL007W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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