RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)B

tT(AGU)B, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)BtT(AGU)B USA1Q03714 838 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B RKM2Q03942 479 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B CTK1Q03957 528 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YML096WQ04489 525 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B RRN11Q04712 507 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B ARG7Q04728 441 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B RCO1Q04779 684 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B STP3Q05937 343 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YLR456WQ06199 204 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YLR177WQ06251 628 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B ERF2Q06551 359 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B ATG23Q06671 453 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YFT2Q06676 274 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YET3Q07451 203 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B VAM6Q07468 1049 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YDL129WQ07555 291 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PSR1Q07800 427 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data0.69□□□□□ -2.3not detected
tT(AGU)BtT(AGU)B OPI10Q08202 246 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YOL036WQ08206 761 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B BSC6Q08280 497 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B MPC54Q08550 464 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B GUP2Q08929 609 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PFA4Q12006 378 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B TRM8Q12009 286 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B TGL5Q12043 749 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B NUS1Q12063 375 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B MCD1Q12158 566 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B RUD3Q12234 484 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SUL2Q12325 893 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B FRE7Q12333 620 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B RKM5Q12367 367 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B NCA2Q12374 616 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B ICT1Q12385 394 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B ZRT2Q12436 422 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B NSI1Q12457 570 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YMR030W-AQ3E760 96 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YKL018C-AQ3E7A7 99 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B NOP14Q99207 810 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SEY1Q99287 776 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B FAB1P34756 2278 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B COX1P00401 534 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B COX6P00427 148 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B ATP6P00854 259 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B AI4P03878 556 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B HXK2P04807 486 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B HTA2P04912 132 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B CMD1P06787 147 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B CYT1P07143 309 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SEC53P07283 254 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B CAR2P07991 424 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SPS1P08458 490 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B HOM3P10869 527 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B MRP13P12686 339 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B GUK1P15454 187 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PDC5P16467 563 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PHO81P17442 1178 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PET123P17558 318 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SNF5P18480 905 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B STE4P18851 423 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B DAL82P21705 255 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B BAS1P22035 811 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SEC15P22224 910 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B MRPL25P23369 157 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SEC14P24280 304 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B RBK1P25332 333 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PHO87P25360 923 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YCL049CP25577 312 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PBN1P25580 416 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SPB1P25582 841 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B IMG1P25626 169 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B RSC6P25632 483 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YCR090CP25654 182 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B BUB3P26449 341 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B CTS1P29029 562 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B BEM1P29366 551 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B FAA1P30624 700 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SIN4P32259 974 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B NDI1P32340 513 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PHA2P32452 334 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B HXT4P32467 576 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B MKK2P32491 506 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data0.68□□□□□ -2.3not detected
tT(AGU)BtT(AGU)B SFA1P32771 386 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B MGM101P32787 269 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B YSC84P32793 468 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PTM1P32857 523 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B MRS6P32864 603 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B CYM1P32898 989 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B WBP1P33767 430 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SIP2P34164 415 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B SKT5P34226 696 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B LST4P34239 828 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B PEX5P35056 612 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)BtT(AGU)B TAF14P35189 244 aa0.68□□□□□ -2.3
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