RNA–Protein interactions for RNA: tC(GCA)B

tC(GCA)B, Transcript of Cysteine tRNA (tRNA-Cys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tC(GCA)B, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tC(GCA)BtC(GCA)B RNH1Q04740 348 aa3.07□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YPS7Q06325 596 aa3.07□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B NBA1Q08229 501 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YOL159CQ08300 171 aa3.07□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SLH1P53327 1967 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B BIK1P11709 440 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B ERG9P29704 444 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B RPC25P35718 212 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B VRG4P40107 337 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YIL169CP40442 995 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SNO3P43544 222 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B ECO1P43605 281 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B MET12P46151 657 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YJR115WP47152 169 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SEH1P53011 349 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B PLB2Q03674 706 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B TAF12Q03761 539 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B ENT5Q03769 411 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B RGT2Q12300 763 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B GEP5Q12393 293 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B NHA1Q99271 985 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B IZH4Q99393 312 aa3.06□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B GLK1P17709 500 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SFL1P20134 766 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SAC6P32599 642 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SRP101P32916 621 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YKL187CP34231 750 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SWC5P38326 303 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B FMP52P40008 231 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B TMN3P40071 706 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B RGI2P40188 164 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B XBP1P40489 647 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YIL012WP40551 113 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YJR039WP47107 1121 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B COS12P53053 380 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B ERG13P54839 491 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC55Q00362 526 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B OSH6Q02201 448 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B CCE1Q03702 353 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YDR109CQ04585 715 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YPR022CQ12139 1133 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YPR071WQ12346 211 aa3.05□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B KAR1P11927 433 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B GFA1P14742 717 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YSP3P25036 478 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SRB5P32585 307 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B PCH2P38126 564 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B TDP1P38319 544 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B MTC4P38335 694 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B BIO3P50277 480 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B MAL11P53048 616 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B VPS9P54787 451 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B RSC4Q02206 625 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B NUP100Q02629 959 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YDR222WQ04925 415 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B COG4Q06096 861 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B GAS2Q06135 555 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B RSC3Q06639 885 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B MMT2Q08970 484 aa3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B FLO9P39712 1322 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B MET8P15807 274 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SAC7P17121 654 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B TRX1P22217 103 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B RPI1P23250 407 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B MGR1P25573 417 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B IMP3P32899 183 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B BCK2P33306 851 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YKL102CP34249 101 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
tC(GCA)BtC(GCA)B TDA3P38758 523 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B AIM18P38884 321 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B SLZ1P40167 298 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B UTP18P40362 594 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B HXT8P40886 569 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B VMA13P41807 478 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B GCV1P48015 400 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B TOM22P49334 152 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YGR237CP50089 785 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B MON1P53129 644 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B OAZ1Q02803 292 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B YAP7Q08182 245 aa3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
tC(GCA)BtC(GCA)B ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SWI5P08153 709 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B RNR2P09938 399 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B LAT1P12695 482 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B MSS116P15424 664 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SLY1P22213 666 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YCR015CP25616 317 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.1 ms