RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.88	□□□□□ -1.79	not detected
PPQ1	YPL179W	ALY1	P36117	915 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SMF2	P38778	549 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	HEM14	P40012	539 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	CHS6	P40955	746 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	IML2	P47031	731 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	DOS2	P54858	310 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	TOF2	Q02208	771 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YPL014W	Q02606	381 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	AAD15	Q08361	143 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ENV7	Q12003	364 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YLR046C	Q12253	270 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	LDB17	Q12342	491 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	MPH2	P0CD99	609 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ADH4	P10127	382 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SEC63	P14906	663 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.87	□□□□□ -1.79	not detected
PPQ1	YPL179W	CLN1	P20437	546 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	KIN3	P22209	435 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SGF29	P25554	259 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	KAR4	P25583	335 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	GEX1	P25596	615 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	GDA1	P32621	518 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	NFU1	P32860	256 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	GEX2	P36173	615 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	APM3	P38153	483 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	FUI1	P38196	639 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	OCA5	P38738	679 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	CTF8	P38877	133 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	PAN6	P40459	309 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SDP1	P40479	209 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SAE2	P46946	345 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YKR011C	Q02209	353 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SHR3	Q02774	210 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YLR012C	Q07927	99 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	PUS9	Q12069	462 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	PEX11	Q12462	236 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	RMD5	Q12508	421 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YLR149C	Q99296	730 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	TOP3	P13099	656 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	MRPL8	P22353	238 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	RBK1	P25332	333 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SED4	P25365	1065 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YCL068C	P25593	260 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YME1	P32795	747 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	DUN1	P39009	513 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	EXO1	P39875	702 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	PHO23	P50947	330 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	RTA1	P53047	317 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	EMC4	P53073	190 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	VAC7	P53950	1165 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	STE23	Q06010	1027 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	PGC1	Q08959	321 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	PER33	Q12144	273 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	CAN1	P04817	590 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	DAL81	P21657	970 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	URA10	P30402	227 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SMI1	P32566	505 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	OAF3	P36023	863 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	EMC3	P36039	253 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	RPC37	P36121	282 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	BET3	P36149	193 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	MRPL40	P36534	297 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	ETR1	P38071	380 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	NIT3	P49954	291 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	SAP4	P53036	818 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	NUP100	Q02629	959 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PPQ1	YPL179W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79

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