RNA–Protein interactions for RNA: YNR043W

MVD1, Transcript of Mevalonate pyrophosphate decarboxylase, yeast

Gene MVD1, Length 1,191 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MVD1	YNR043W	DSS4	P32601	143 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	FRE1	P32791	686 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	SAW1	P39735	261 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	NRM1	P53718	249 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	MUB1	Q03162	620 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	RPN13	O13563	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	RAD3	P06839	778 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	SDS22	P36047	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ERV46	P39727	415 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	YEL020C	P39994	560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ASK10	P48361	1146 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	FLC3	P53121	802 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	FOB1	O13329	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	GAL4	P04386	881 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ATP4	P05626	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	TPK2	P06245	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	STE12	P13574	688 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	LTP1	P40347	161 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	GUF1	P46943	645 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	BUD17	P53727	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	RTC4	P53850	401 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	MET14	Q02196	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	TRI1	Q05024	226 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	SUL2	Q12325	893 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	CNE1	P27825	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	DSE1	P40077	573 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ASG1	P40467	964 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	COQ5	P49017	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	NBP2	Q12163	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	LCB4	Q12246	624 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	COX3	P00420	269 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ADH4	P10127	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ADY2	P25613	283 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	MIC60	P36112	540 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ECM13	P38195	257 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	SWD1	P39706	426 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	IMA5	P40884	581 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	UFE1	P41834	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	SMC3	P47037	1230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	MRK1	P50873	501 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	USA1	Q03714	838 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	GIS1	Q03833	894 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	HOF1	Q05080	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	MLC2	Q06580	163 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ARP7	Q12406	477 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	GAL1	P04385	528 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	XRS2	P33301	854 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	PPZ2	P33329	710 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	SGE1	P33335	543 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	LOT5	P34234	306 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	MRPL40	P36534	297 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	YLF2	P38746	405 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	LCB2	P40970	561 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	CDC1	P40986	491 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	YJR054W	P47114	497 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	CPR8	P53728	308 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	AQR1	P53943	586 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	PIR3	Q03180	325 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	DON1	Q05610	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	DDC1	Q08949	612 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	TGS1	Q12052	315 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	RKM5	Q12367	367 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MVD1	YNR043W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MVD1	YNR043W	RRT12	P25381	491 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MVD1	YNR043W	PTP2	P29461	750 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MVD1	YNR043W	PAC2	P39937	518 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MVD1	YNR043W	YGL117W	P53133	265 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MVD1	YNR043W	SWS2	P53937	143 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MVD1	YNR043W	TRM82	Q03774	444 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MVD1	YNR043W	HRD3	Q05787	833 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.4 ms