RNA–Protein interactions for RNA: YML049C

RSE1, Transcript of Protein involved in pre-mRNA splicing, yeast

Gene RSE1, Length 4,086 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSE1	YML049C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
RSE1	YML049C	ELO3	P40319	345 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RRN7	P40992	514 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	SPG5	P42933	373 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	HXT16	P47185	567 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	HXT15	P54854	567 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	EMI1	Q04406	187 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	CIA1	Q05583	330 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YLR177W	Q06251	628 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	ATG23	Q06671	453 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
RSE1	YML049C	SIN4	P32259	974 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	UTR2	P32623	467 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	ALG3	P38179	458 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	MNN1	P39106	762 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RPH1	P39956	796 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YGR012W	P53206	393 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	ZRG17	P53735	605 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	FMN1	Q03778	218 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RKM2	Q03942	479 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	THI7	Q05998	598 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	GTT2	Q12390	233 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	SLY41	P22215	453 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	BLI1	P35727	113 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	BYE1	P36106	594 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	HIS2	P38635	335 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YHR045W	P38775	560 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	IGO1	P53897	168 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	PIR1	Q03178	341 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	TRM8	Q12009	286 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	MEF1	P25039	761 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	KIP2	P28743	706 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	FLC2	P39719	783 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	HOC1	P47124	396 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	CDC55	Q00362	526 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
RSE1	YML049C	IRC13	Q08630	104 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	AIM41	Q12032	185 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RCN2	Q12044	265 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	CYC2	P38909	366 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	MBP1	P39678	833 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	MRK1	P50873	501 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	NBP35	P52920	328 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	MKC7	P53379	596 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YNL144C	P53907	740 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YDR132C	Q03900	495 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	BUD7	Q08754	746 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	PGC1	Q08959	321 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	KAR1	P11927	433 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	CWH43	P25618	953 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	VHC1	P38329	1120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	LYS9	P38999	446 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YAT2	P40017	923 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RPN14	P53196	417 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	TIM10	P87108	93 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YDR131C	Q03899	556 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	PNP1	Q05788	311 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
RSE1	YML049C	MKK2	P32491	506 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	SMI1	P32566	505 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	STB6	P36085	766 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	YOL019W	Q08157	551 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	PET123	P17558	318 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	AAD3	P25612	363 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	ADY2	P25613	283 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	RIM11	P38615	370 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	GIP2	P40036	548 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	GCV1	P48015	400 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	EMC4	P53073	190 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	GIC2	Q06648	383 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSE1	YML049C	AAD15	Q08361	143 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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