RNA–Protein interactions for RNA: YKR022C

NTR2, Transcript of Essential protein that forms a dimer with Ntr1p, yeast

Gene NTR2, Length 969 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NTR2	YKR022C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	GPM3	Q12326	303 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	ECM3	Q99252	613 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	LAM4	P38800	1345 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SEC15	P22224	910 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	POL4	P25615	582 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	KRE2	P27809	442 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	MSP1	P28737	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	GYP6	P32806	458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	GEX2	P36173	615 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	MAL33	P38157	468 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	EHT1	P38295	451 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	STB5	P38699	743 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SPL2	P38839	148 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	ATF1	P40353	525 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YLH47	Q06493	454 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	FMP45	Q07651	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	TCO89	Q08921	799 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	ATG29	Q12092	213 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SPE4	Q12455	300 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	ISN1	Q99312	450 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	KIN3	P22209	435 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SYN8	P31377	255 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YEL043W	P32618	956 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	RIB7	P33312	244 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	HEL1	P36113	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	DAD2	P36162	133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YJL206C	P39529	758 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YJL193W	P39542	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	LRO1	P40345	661 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	EFM4	P40516	257 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	IDS2	P46958	469 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	NPA3	P47122	385 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	COS12	P53053	380 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SNF12	P53628	566 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YML037C	Q03703	340 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	UBX2	Q04228	584 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	VPS20	Q04272	221 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	ROY1	Q04847	553 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	GTB1	Q04924	702 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SUT2	Q12286	268 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	AFI1	Q99222	893 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YPT6	Q99260	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YML002W	P0CF17	737 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	CLC1	P17891	233 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	CDC43	P18898	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	VPS34	P22543	875 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	PEX1	P24004	1043 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	URK1	P27515	501 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SRB5	P32585	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	TFB1	P32776	642 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	LTV1	P34078	463 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
NTR2	YKR022C	PHO11	P35842	467 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	PHO12	P38693	467 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YHR054C	P38780	354 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	CCT6	P39079	546 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	BUD16	P39988	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	IME4	P41833	600 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	IRC8	P47046	822 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	FHN1	P53279	174 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	IRC4	Q03036	179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	INM2	Q05533	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	ATG23	Q06671	453 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	BUD7	Q08754	746 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	SWT1	Q12104	458 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	YCR061W	P25639	631 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	DSS4	P32601	143 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	BDH2	P39713	417 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	NDC80	P40460	691 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	NAS2	P40555	220 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	INA17	Q02888	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	MMR1	Q06324	491 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NTR2	YKR022C	ARR3	Q06598	404 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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