RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SEC12	P11655	471 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	AGP2	P38090	596 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MLH1	P38920	769 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SSO2	P39926	295 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ASG1	P40467	964 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	GTS1	P40956	396 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CUR1	Q06469	252 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ARR1	Q06596	294 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ULA1	Q12059	462 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RBD2	Q12270	262 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CAT8	P39113	1433 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	GLG1	P36143	616 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RFC5	P38251	354 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ELO3	P40319	345 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MAF1	P41910	395 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MSC2	Q03455	724 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	POM34	Q12445	299 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RAD61	Q99359	647 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	UNG1	P12887	359 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	TUP1	P16649	713 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	VPS33	P20795	691 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	DCG1	P32460	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YHR112C	P38716	378 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	IAH1	P41734	238 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	COX18	P53239	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CRF1	Q04930	467 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	BOP2	Q06150	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YFH1	Q07540	174 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CBP1	P07252	654 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	NDI1	P32340	513 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	KRE6	P32486	720 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	TPO5	P36029	618 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	APT2	P36973	181 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ALG5	P40350	334 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YIL077C	P40508	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YFR018C	P43599	363 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	IDS2	P46958	469 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ASI2	P53895	289 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CUZ1	P53899	274 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ACL4	Q03771	387 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	FIN1	Q03898	291 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ATG23	Q06671	453 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	BUG1	Q12191	341 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	VPS63	O13549	108 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	COT1	P32798	439 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MSN4	P33749	630 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PFF1	P38244	976 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YBR259W	P38338	688 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	BZZ1	P38822	633 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YJL206C	P39529	758 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ECM1	P39715	212 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YJL132W	P47014	750 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ECM27	P47144	725 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YGR149W	P48236	432 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RLM1	Q12224	676 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SPO7	P18410	259 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
SYF1	YDR416W	PRD1	P25375	712 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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